[Gate-users] NaN errors on some pixels of regularMatrix phantom in CTScanner system

Janus nxchu at foxmail.com
Fri Apr 19 03:23:55 CEST 2013


Dear Gate users, 

I attached an DoseActor to the regularMatrix phantom on a CTScanner system. The following macros show how I collect dose:
/gate/actor/addActor DoseActor mActor
/gate/actor/mActor/save ./output/PhantomDose.txt
/gate/actor/mActor/attachTo NCAT #the name of my regularMatrix phantom
/gate/actor/mActor/enableEdep false
/gate/actor/mActor/enableUncertaintyEdep false
/gate/actor/mActor/enableSquaredEdep false
/gate/actor/mActor/enableDose true
/gate/actor/mActor/enableUncertaintyDose true
/gate/actor/mActor/normaliseDose false
/gate/actor/mActor/setResolution 72 88 63 #the pixel size is the same with the size of regularMatrix

After the simulation (more than 10^7 events), I got the output file "PhantomDose-Dose-Uncertainty.txt" that I expected. However, I found some NaN value in the file. It looks like: 
0.335632 nan 0.283809 0.277518 0.311712 0.232881 nan nan nan 0.14158 nan nan nan 0.11352 0.118089 nan nan nan nan 0.117827 nan nan 0.111348 nan nan 0.114444 nan 0.120727 0.112061 nan nan nan nan nan nan nan nan 0.114227 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 0.112236 nan nan 0.116712 nan nan nan nan nan nan 0.0982464 nan 0.695156 0.736034 0.694313 0.501348 0.876738 0.593643 0.684897 
0.387904 0.308451 0.292645 0.307023 0.274505 0.196699 nan 0.125794 0.119966 0.122969 nan 0.0921764 nan nan 0.116727 nan nan nan nan 0.121635 nan nan 0.089028 nan nan nan 0.115871 0.110041 0.120644 nan nan nan nan nan nan 0.113381 nan nan nan 0.115092 0.109492 nan nan nan nan nan nan nan 0.122921 nan nan nan nan nan nan nan nan 0.110586 nan nan 0.103074 nan nan nan nan 1 0.712306 0.555066 0.52936 0.792737 0.498393 0.627436 

Please can any expert tell me why I got these errors? 

Any suggestions or comments will be sincerely appreciated.

Best regards,



Janus
-------------- next part --------------
An HTML attachment was scrubbed...
URL: <http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/private/gate-users/attachments/20130419/67da1b83/attachment.html>


More information about the Gate-users mailing list