<div dir="ltr">Dear Catarina,<div><br></div><div>please have a look at our last paper describing the workflow ProTheraMon, which I guess does something you would expect.</div><div><br></div><div>Damian Borys et al 2022 Phys. Med. Biol. 67 224002<br>DOI 10.1088/1361-6560/ac944c<br></div><div><br></div><div><a href="https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6560/ac944c">https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6560/ac944c</a></div><div><br></div><div>best<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><span style="color:rgb(153,153,153)">------------------------------------------------------------</span><br style="color:rgb(153,153,153)"><font size="2" style="color:rgb(153,153,153)"><span style="color:rgb(0,0,0)">Jan Gajewski</span></font><br></div></div></div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, 18 Nov 2022 at 11:56, Catarina Magalhães <<a href="mailto:anacatarinamagalhaes@ua.pt">anacatarinamagalhaes@ua.pt</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div class="msg6400373496764362459">




<div dir="ltr">
<div id="m_5677707924323904267divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif" dir="ltr">
<p></p>
<div id="m_5677707924323904267Item.MessageUniqueBody" style="font-family:wf_segoe-ui_normal,"Segoe UI","Segoe WP",Tahoma,Arial,sans-serif,serif,EmojiFont">
<div>
<div dir="ltr">
<div id="m_5677707924323904267divtagdefaultwrapper"><font style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,serif,EmojiFont" size="3" face="Calibri,Helvetica,sans-serif" color="black"><span style="font-size:12pt" id="m_5677707924323904267divtagdefaultwrapper"></span></font><font style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,serif,EmojiFont" size="3" face="Calibri,Helvetica,sans-serif" color="black"><span style="font-size:12pt" id="m_5677707924323904267divtagdefaultwrapper">
<div><span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">Dear Gate users,</span></font></span>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt"> </span></font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">I am trying to simulate the production of positrons in a PMMA phantom when irradiated with a proton beam and use that information to obtain a simulated PET image.
 For this, I am running two separate simulations. In the 1</span></font><font size="-1" color="black">^st</font><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">, I save the positron production in a .root file, using the PhaseSpaceActor.
 In the 2</span></font><font size="-1" color="black">^nd</font><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">, I use the PhaseSpace .root file as a source for the PET simulation and save the PET data in a .root file. However, I obtain
 the majority of positrons in the phantom contour (is this because the PhaseSpaceActor only stores the particles entering and exiting the volumes?).
</span></font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt"> </span></font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">Besides, I also tried to use the ProductionAndStoppingActor to obtain the positron map. However, I was not able to use the .mhd image as a source in the PET simulation.
 I already tried to search in the Gate users archive and did not find anything. </span>
</font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt"> </span></font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt;background-color:white">Thank you in advance,</span></font></span></div>
<div style="background-color:white;margin-top:0px;margin-bottom:0px" align="justify">
<span style="background-color:white"><font size="3" color="black"><span style="font-size:12pt">Catarina Magalhães.</span></font></span></div>
</div>
</span></font></div>
</div>
</div>
</div>
<br>
<p></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></div></blockquote></div>