<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Dear GATE users,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am simulating a cylindricalPET system around a patient. The scanner is quite close to the patient and so the voxelised phantom will very often overlap the scanner, typically where the voxels correspond to air. Using the mumap actor I can see
 this overlap, leading to missing detector segments, and in the root output I can see that these missing segments do not receive any hits.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If I crop the CT then I am trying to fit a square into a circle, and I lose sections of the patient CT.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I have tried reordering the scanner -> patient -> source definitions to see if hierarchy matters, but it appears that the overlap occurs anyway.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">What is the best way to solve this issue?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks for your help,</div>
<div class="">Keegan</div>
<div class="">
<div class="">
<div dir="auto" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
________________________________________________<br class="">
Paul Scherrer Institut<br class="">
Keegan McNamara<br class="">
WBBB/105<br class="">
CH 5232 Villigen PSI<br class="">
<br class="">
Phone:   +41 56 310 57 62<br class="">
<a href="mailto:keegan.mcnamara@psi.ch" class="">E-Mail:   keegan.mcnamara@psi.ch</a></div>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>