<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]--><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi everyone<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I have a macro up and running using vGate 9.0 which imports PET and CT data to generate a dose distribution. It seems to be working fine, but only uses one CPU core (which I believe is a known “feature” of Gate). My computer has 8 cores
 acting as 16 logical processors and Oracle VM currently has access to 8 cores. I’m not sure if this is the full 8 physical (one logical from each core) or 4 physical (two logical from each). An obvious speeding up of the process would be to use the jobsplitter
 and filemerger in order to utilise more cores, but I’m not sure if this is a possibility within vGate 9.0.
<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">In the ReadTheDocs documentation, there is a section on using job splitter etc. on a cluster but this requires additional installation, plus a “cluster aware version of Gate”. My gut instinct is that vGate 9.0 isn’t one of those versions
 but I was wondering if anyone had been successful or has any other tips on getting vGate to utilise my cpu power more effectively?<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Thank you<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">Mark Baker<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">Senior Clinical Scientist<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">Imaging Physics (Ionising)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">The Clatterbridge Cancer Centre NHS Foundation Trust<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">CCCW Tel:  0151 556 5030
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">CCCL Tel: 0151 318 8438<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">Email:
</span><span style="color:#4472C4;mso-fareast-language:EN-GB"><a href="mailto:mark.baker23@nhs.net"><span style="color:#4472C4">mark.baker23@nhs.net</span></a></span><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#4472C4;mso-fareast-language:EN-GB"><a href="https://teams.microsoft.com/l/chat/0/0?users=mark.baker23@nhs.net"><span style="color:#4472C4">Microsoft Teams (click here)</span></a><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB"> <span style="color:#006871"><o:p></o:p></span></span></p>
<p class="MsoNormal"><i><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">Honorary Lecturer, Dept. of Physics<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB">University of Liverpool<o:p></o:p></span></i></p>
<p class="MsoNormal"><span style="color:#006871;mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB"><img border="0" width="624" height="163" style="width:6.5in;height:1.6979in" id="Picture_x0020_3" src="cid:image002.jpg@01D7DC7C.C624E0C0" alt="CCC email footer April 2021"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="mso-fareast-language:EN-GB"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<br>
<font face="Courier New" color="Black" size="2"><br>
************************************************************************************** ******************************<br>
<br>
This message may contain confidential information. If you are not the intended recipient please:<br>
i) inform the sender that you have received the message in error before deleting it; and
<br>
ii) do not disclose, copy or distribute information in this e-mail or take any action in relation to its content (to do so is strictly prohibited and may be unlawful).
<br>
Thank you for your co-operation.<br>
<br>
NHSmail is the secure email, collaboration and directory service available for all NHS staff in England. NHSmail is approved for exchanging patient data and other sensitive information with NHSmail and other accredited email services.<br>
<br>
For more information and to find out how you can switch visit <a href="https://support.nhs.net/article-categories/joining-nhsmail/">
Joining NHSmail – NHSmail Support</a><br>
<br>
</font>
</body>
</html>