<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
      charset=windows-1252">
  </head>
  <body>
    <p>Hi Daniela,<br>
      <br>
      I'm not 100% sure if this is your problem, but I noticed you
      didn't attach a sensitive detector to your phantom - I think that
      may be necessary. It should just be this line:<br>
    </p>
    <pre style="overflow: auto hidden; font-family: Consolas, Menlo, "DejaVu Sans Mono", "Bitstream Vera Sans Mono", monospace; font-size: 0.9em; background: rgb(238, 238, 238); padding: 7px 30px; margin: 15px 0px; line-height: 19.125px; color: rgb(62, 67, 73); font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left; text-indent: 0px; text-transform: none; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration-thickness: initial; text-decoration-style: initial; text-decoration-color: initial;">/gate/PMMA/<span class="o" style="color: rgb(88, 40, 0);"></span><span class="n" style="color: rgb(0, 0, 0);">attachPhantomSD</span>
</pre>
    More info here:<br>
    <br>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://opengate.readthedocs.io/en/latest/sensitive_detector_concept.html#the-phantomsd">https://opengate.readthedocs.io/en/latest/sensitive_detector_concept.html#the-phantomsd</a><br>
    <p>Let me know if this works!<br>
    </p>
    Best,<br>
    Cassandra<br class="Apple-interchange-newline">
    <br>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 

Cassandra Miller
PhD Student, Physics 
Quantitative Radiomolecular Imaging and Therapy Lab
Department of Physics and Astronomy, University of British Columbia</pre>
    <div class="moz-cite-prefix">On 2020-12-09 1:07 p.m., Botnariuc,
      Daniela wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:AM6PR0102MB33686DB6B851410C5300D2AC85CC0@AM6PR0102MB3368.eurprd01.prod.exchangelabs.com">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        mso-fareast-language:EN-US;}size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}</style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal">Dear Gate users, <o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">I am simulating a proton pencil beam and I
          am trying to score the depth-dose curve in a cylindrical
          geometry. When I attach the dose actor to the cylindrical
          geometry, it appears that the dose is being calculated in a
          box as opposed to a cylinder. I ran the same simulation but
          scoring dose in a cuboid geometry whose X and Y lengths were
          the same as the diameter (for the same depth resolution) of
          the cylindrical volume and I get the exact same curve. How
          would I define the dose actor in order to score dose in the
          cylinder?<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">#GEOMETRY<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/world/daughters/name   PMMA<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/world/daughters/insert cylinder<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/geometry/setRmax 4.08 cm<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/geometry/setRmin 0. mm<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/geometry/setHeight 20 cm<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/placement/setTranslation 0 0
          0.10 m<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/setMaterial Water<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/vis/setColor cyan<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/PMMA/describe<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">#DOSE ACTOR<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/addActor   DoseActor  
          depthdose<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/attachTo   PMMA<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/stepHitType   random<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/setPosition   0 0 0
          mm<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/setResolution   1  1
          1000 mm<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/saveEveryNSeconds  
          60<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/enableDose   true<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">/gate/actor/depthdose/enableUncertaintyDose  
          true<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Thank you in advance for your time. <o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Best wishes, <o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">Daniela <o:p></o:p></p>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <pre class="moz-quote-pre" wrap="">_______________________________________________
Gate-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></pre>
    </blockquote>
  </body>
</html>