<div dir="ltr"><br><div>this is really great ! </div><div><br></div><div>I think it could be interesting to put a link to your repository in the Gate documentation. </div><div>Can you please provide some input please? It is easy, just look in the documentation (<a href="https://opengate.readthedocs.io/en/latest/">https://opengate.readthedocs.io/en/latest/</a>) where it is the best to advertise your code (maybe at the end of the section "Imaging Application", with an additional subsection "Image Reconstruction" ?) and create a Pull Request (black menu "edit on github"). </div><div><br></div><div>I think it could be nice also to cite and link to other reconstruction code such as Castor or RTK. </div><div><br></div><div>Thanks again ! </div><div>David</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Nov 13, 2020 at 7:25 PM Twyman, Robert <<a href="mailto:robert.twyman.18@ucl.ac.uk">robert.twyman.18@ucl.ac.uk</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">



<div style="overflow-wrap: break-word;">
<div style="color:rgb(0,0,0)">Dear all,</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><br>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">I am pleased to announce the release of v1.0 of the STIR-GATE-Connection:</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><a href="https://github.com/UCL/STIR-GATE-Connection/releases/tag/v1.0" target="_blank">https://github.com/UCL/STIR-GATE-Connection/releases/tag/v1.0</a> </div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><br>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">This project aims to link GATE, a Monte-Carlo simulation toolkit for medical physics applications, with STIR (Software for Tomographic Image Reconstruction) by:</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">
<div>• creating a GATE compatible voxelised phantom, from a parameter file or interfile, using STIR functionality<br>
</div>
<div>• setting up and running GATE simulations in cluster array jobs<br>
</div>
<div>• combining and unlisting root list mode files into sinogram format for reconstruction using STIR</div>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><span>• computing normalisation factors and randoms estimation from delayed events (in future scatter estimation)</span></div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><br>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">We will continue to further develop this project and welcome any and all contributions in the form of examples GATE scanner geometries and modifications to the existing scripts. Please feel
 free to raise issues on the GitHub. </div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><br>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">Please cite our v1.0 release : <a href="https://zenodo.org/record/4271795" target="_blank">https://zenodo.org/record/4271795</a> </div>
<div style="color:rgb(0,0,0)"><br>
</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">Take care!</div>
<div style="color:rgb(0,0,0)">Robert Twyman</div>
</div>

_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">David Sarrut, Phd<br>Directeur de recherche CNRS<br>CREATIS, UMR CNRS 5220, Inserm U1206<div>Centre de lutte contre le cancer Léon Bérard<br>28 rue Laënnec, 69373 Lyon cedex 08<br>Tel : 04 78 78 51 51 / 06 74 72 05 42<br><a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut</a><br>_________________________________</div><div> "2 + 2 = 5,  for extremely large values of 2"<br>_________________________________</div></div></div></div></div></div></div>