<div dir="ltr">Hi, <div><br></div><div>also the python gatetools : <a href="https://github.com/OpenGATE/GateTools">https://github.com/OpenGATE/GateTools</a> with a command line such as : </div><div><pre style="box-sizing:border-box;font-family:SFMono-Regular,Consolas,"Liberation Mono",Menlo,monospace;font-size:13.6px;margin-top:0px;margin-bottom:16px;padding:16px;overflow:auto;line-height:1.45;background-color:rgb(246,248,250);border-radius:3px;color:rgb(36,41,46)"><code style="box-sizing:border-box;font-family:SFMono-Regular,Consolas,"Liberation Mono",Menlo,monospace;font-size:13.6px;padding:0px;margin:0px;background:initial;border-radius:3px;word-break:normal;border:0px;display:inline;overflow:visible;line-height:inherit">gt_gamma_index dose1.mhd gate2.mhd -o gamma.mhd --dd 2 --dta 2.5 -u "%" -T 0.2
</code></pre>David</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Jun 22, 2020 at 1:53 PM Jeremy Leste <<a href="mailto:jeremy.leste@inserm.fr">jeremy.leste@inserm.fr</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><u></u>
<div>
<p><span style="font-family:Arial;font-size:12px">Hi, </span></p>
<p><span style="font-family:Arial;font-size:12px">One of the option is to use Slicer3D:  <a title="https://www.slicer.org/" href="https://www.slicer.org/" target="_blank">https://www.slicer.org/</a></span></p>
<p>There is radiotherapy module with 3D Gamma-index or DVH  tool etc.. : <a href="http://slicerrt.github.io/" target="_blank">http://slicerrt.github.io/</a></p>
<p>Regards</p>
<p>Jeremy Leste</p>
<p> </p>
<div>
<pre>--</pre>
</div>
<p>Le 2020-06-21 14:18, amir bahador yeke dehghan a écrit :</p>
<blockquote type="cite" style="padding-left:5px;border-left:2px solid rgb(16,16,255);margin-left:5px;width:100%">
<div dir="ltr">Hi dear gate users
<div>can you guide me how can I calculate gamma index in dose outputs?is there any application to calculate 2D or 3D gamma index with these outputs?</div>
<div>I used dose actor in my simulation and have dose.mhd and dose.raw files.</div>
<div>best regards.</div>
</div>
<br>
<pre>_______________________________________________
Gate-users mailing list
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></pre>
</blockquote>
</div>
_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">David Sarrut, Phd<br>Directeur de recherche CNRS<br>CREATIS, UMR CNRS 5220, Inserm U1206<div>Centre de lutte contre le cancer Léon Bérard<br>28 rue Laënnec, 69373 Lyon cedex 08<br>Tel : 04 78 78 51 51 / 06 74 72 05 42<br><a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut</a><br>_________________________________</div><div> "2 + 2 = 5,  for extremely large values of 2"<br>_________________________________</div></div></div></div></div></div></div>