<div dir="ltr">Hi Xinjie, <div><br></div><div>Has it thrown any error message? I also followed the instruction (the second link in your email) step by step. Although I also had some minor issues at the very beginning, I got it to work very well. To me,  the only thing I need to add to condor.script to make it work is adding "getenv=true" to the script. </div><div><br></div><div>Here are my suggestions to debug: </div><div><br></div><div><ul><li>First, make sure that your GATE code runs correctly in non-Server mode and check the output;</li><li>Second, make sure that Condor runs normally. </li><li>Third, try to run your GATE code with condor. </li></ul></div><div><br></div><div>If you have further questions, please let me know. </div><div><br></div><div>Good luck,</div><div><br></div><div>Zhengzhi </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Mar 30, 2020 at 7:09 AM Xinjie Cao <<a href="mailto:xinjie.cao@stonybrook.edu">xinjie.cao@stonybrook.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I am using HTCondor platform for GATE cluster running with the following guides:</div><div>1.<a href="http://www.opengatecollaboration.org/Materials2015/PracticalExercises2015/RunningGATECluster" target="_blank">http://www.opengatecollaboration.org/Materials2015/PracticalExercises2015/RunningGATECluster</a></div><div>2.<a href="https://opengate.readthedocs.io/en/latest/how_to_use_gate_on_a_cluster.html" target="_blank">https://opengate.readthedocs.io/en/latest/how_to_use_gate_on_a_cluster.html</a></div><div><br></div><div>I can run every step but just always get wrong output with 0 byte .out file. I am a rookie to GATE cluster running, any reply will be highly appreciated. Thank you!</div><div><br></div><div>Best,<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><b><font color="#000000">....................................................</font></b><br></div><div><b><span style="color:rgb(153,0,0);font-family:"arial black",sans-serif;font-size:x-small">Xinjie Cao</span></b><br></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">M.E. / Ph.D. student</font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Research Project Assistant</font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Department of Electrical and Computer Engineering & Radiology </font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Novel Medical Imaging Technologies Lab</font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Health Science Center Level 8</font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Stony Brook, NY 11794-8460 </font></b></div><div><b><font size="1" face="arial black, sans-serif">Tel: +1 (631)202-9445</font></b></div><div><a href="https://you.stonybrook.edu/goldan/people/" target="_blank">you.stonybrook.edu/goldan/people/</a><b><font size="1" face="arial black, sans-serif"><br></font></b></div><div><font size="1" face="arial black, sans-serif"><b>email: </b><a href="mailto:xinjie.cao@stonybrook.edu" target="_blank"><b>xinjie.cao@stonybroo</b>k.edu</a></font></div><div><font size="1" face="arial black, sans-serif"><br></font></div><div><font size="1" face="arial black, sans-serif"> </font><img src="https://docs.google.com/uc?export=download&id=12iMPAuaMtpKRdkcmBleVsP6iWiM4wlm_&revid=0B_TLWOu4jP1eWnFFRW9qQXlicTY3ZTVzWnR5QkRVY3RRT3JVPQ" width="200" height="28">   <img src="https://drive.google.com/a/stonybrook.edu/uc?id=17TB1Ha3enD8HC5e_Ez238vpeBF92aCgH&export=download" width="200" height="33"></div><div><div><b><font color="#000000">....................................................</font></b></div><div>It is prohibited to distribute or publish the files attached to any other people unless you get permission from the writer himself. All rights reserved.</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></blockquote></div>