<div dir="ltr"><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">Dear Gate User:</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">Using Geant 4.10.04.p02 and gate_v8.1.p01, I’m testing the influence of using differences “Physics” for the EM processes and see how </span></font></font><span style="font-family:"Liberation Serif",serif;font-size:12px">change </span><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">the coincidence detection deficiency and the TOF of my Cherenkov-TOF-PET using a point source. </span></font></font><font face="Liberation Serif, serif"><font style=""><span style="background:transparent"><span style="font-size:9pt">For the optical processes I always used the same physics and cuts....</span></span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">- Using the EM for the benchmarkPET: 7.44 % of coincidence detection efficiency and 66 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess PhotoElectric</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/PhotoElectric/setModel StandardModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Compton</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Compton/setModel StandardModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess RayleighScattering</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/RayleighScattering/setModel PenelopeModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess ElectronIonisation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/ElectronIonisation/setModel StandardModel e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/ElectronIonisation/setModel StandardModel e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Bremsstrahlung</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel StandardModel e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel StandardModel e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess PositronAnnihilation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess eMultipleScattering e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess eMultipleScattering e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">- Using a Combination of different models 1: 7.39 % of coincidence detection efficiency and 66 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess PhotoElectric</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/PhotoElectric/setModel StandardModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Compton</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Compton/setModel StandardModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess RayleighScattering</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/RayleighScattering/setModel LivermoreModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess ElectronIonisation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/ElectronIonisation/setModel StandardModel e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/ElectronIonisation/setModel StandardModel e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Bremsstrahlung</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel StandardModel e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel StandardModel e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess PositronAnnihilation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess eMultipleScattering</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/eMultipleScattering/setGeometricalStepLimiterType e- distanceToBoundary</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/eMultipleScattering/setGeometricalStepLimiterType e+ distanceToBoundary</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addAtomDeexcitation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess RadioactiveDecay</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">- Using a Combination of different models 2: 7.60 % of coincidence detection efficiency and 66 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Compton gamma</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess PhotoElectric</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Compton/setModel PenelopeModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/PhotoElectric/setModel PenelopeModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess ElectronIonisation e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess ElectronIonisation e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/ElectronIonisation/setModel PenelopeModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess eMultipleScattering e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess eMultipleScattering e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/eMultipleScattering/setGeometricalStepLimiterType e- distanceToBoundary</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/eMultipleScattering/setGeometricalStepLimiterType e+ distanceToBoundary</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess Bremsstrahlung</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel PenelopeModel e-</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/Bremsstrahlung/setModel PenelopeModel e+</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess GammaConversion</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/processes/GammaConversion/setModel PenelopeModel</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">#/gate/physics/addProcess IonIonisation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addProcess RadioactiveDecay</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addAtomDeexcitation</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">- Using different physics list builders:</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emstandard      : 11.09 % of coincidence detection efficiency and 69 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emstandard1  : 10.77 % of coincidence detection efficiency and 95 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emstandard2  : 10.74 % of coincidence detection efficiency and 93 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emstandard3  : 11.09 % of coincidence detection efficiency and 68 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emstandard4  : 11.08 % of coincidence detection efficiency and 78 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emlivermore  : It is not possible to conclude the simulation (Memory Leak)….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList emlivermore_polar  : 11.03 % of coincidence detection efficiency and 68 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">/gate/physics/addPhysicsList empenelope   : 11.00 % of coincidence detection deficiency and 68 ps for the TOF….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><span style="background:transparent"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt">As it is recommended in </font></font><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><a href="http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide:Setting_up_the_physics" target="_blank">http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide:Setting_up_the_physics</a>: I switch all my simulations to the “physic list builder” mechanism for the EM processes, specifically to the (/gate/physics/addPhysicsList emstandard3) recommended </font></font><font face="Liberation Serif, serif"><span style="font-size:9pt">for Medical Physics </span><span style="font-size:12px">Application</span><span style="font-size:9pt"> </span></font><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt">getting reasonable results….</font></font></span></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><span style="background:transparent"><span style="font-size:9pt">However, I would like to know why change in more than 3 % the Cherenkov Photon Coincidences detection efficiency when I use any of the “physic list builder” instead of the EM Physics used in the </span><span style="font-size:12px">Benchmark PET</span><span style="font-size:9pt"> and also why using different “physics list builders” I can get discrepancies for the Ch-TOF of more than 10 ps….</span></span></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">If some user/developer of GATE, GEANT4 can help me to understand this differences, I would appreciate it….</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">Regards,</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">Dania Consuegra Rodríguez</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><font face="Liberation Serif, serif"><font style="font-size:9pt"><span style="background:transparent">PhD student, </span><span style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal">Jožef Stefan Institute</span></font></font></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"><br></p><p align="justify" style="margin-bottom:0in;line-height:13px"></p><br class="gmail-Apple-interchange-newline"></div>