<div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear GATE users,<div><br></div><div>I am trying to run the Time-Activity Curve example provided on Github (<a href="https://github.com/OpenGATE/GateContrib/tree/master/imaging/TimeActivityCurve">https://github.com/OpenGATE/GateContrib/tree/master/imaging/TimeActivityCurve</a>) before going further with my own data. I am facing difficulties to get acceptable results.</div><div><br></div><div>I made a few changes in the <i>mainMacro.mac</i> file otherwise I was not able to run it : </div><div>- In the physics part : I used the physiclist emstandard_opt3</div><div>- In the Cubic voxelized source part : I used imageReader instead of interfileReader (with which the following error occured : <span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><b>GateSourceVoxelInterfileReader.cc (l.25): GateSourceVoxelInterfileReader is obsolete, use GateSourceVoxelImageReader instead!</b> ) </span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><br></span></div><div><font color="#333333" face="sans-serif, Arial, Verdana, Trebuchet MS">The simulation is now running but ::</font></div><div><font color="#333333" face="sans-serif, Arial, Verdana, Trebuchet MS">- I get a lot of warning at the beginning like : </font><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><b style="">GateGeometryVoxelInterfileReader::ReadFile: WARNING: voxel not added (material translation not found); value: 3840</b></span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">- The output root file seems to be empty or nearly empty. I thought it was due to the activites given in the exemple (maximum equal to 1Bq). Thus, I tried to increase by a 1000 factor the activities in the <i>liver.txt</i> file in order to detect more events but the output root file is always as empty as before.</span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><br></span></div><div><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">Moreover, the files <i>activityRange.dat</i> and <i>acti.range</i> seem to be constructed differently than in the wiki. If I try to match what is described on the wiki I get the following error :</span></div><div><b><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">-------- EEEE ------- G4Exception-START -------- EEEE -------</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">*** G4Exception : SetTimeActivTables</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">      issued by : GateVSourceVoxelReader::SetTimeActivTables</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">Aborting...</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">*** Fatal Exception *** core dump ***</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">[G4-cerr]  **** Track information is not available at this moment</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">[G4-cerr]  **** Step information is not available at this moment</span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">[G4-cerr] </span><br style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS"">-------- EEEE -------- G4Exception-END --------- EEEE -------</span>  </b><span style="color:rgb(51,51,51);font-family:sans-serif,Arial,Verdana,"Trebuchet MS""><br></span></div><div><b><br></b></div><div>Did anyone succeeded to run the Time Activity Curve example recently or has any advice to give to solve this issue?<br><br>Kind regards,</div><div><br></div><div>ZARAGORI Timothée</div><div>PhD Student,</div><div>IADI UMR1254</div></div></div>