<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
<p>Hi Sara,</p>
<p><br>
</p>
<p>Could you try to apply a step limiter for electrons in the air region (1 <span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family:
        arial, sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;">
µm) and see if you get a better agreement?</span></p>
<p><br>
</p>
<pre style="font-family: monospace, Courier; color: black; background-color: rgb(249, 249, 249); border: 1px solid rgb(221, 221, 221); padding: 1em; white-space: pre-wrap; line-height: 1.3em; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: 400; letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration-style: initial; text-decoration-color: initial;">/gate/physics/SetMaxStepSizeInRegion [Volume Name] [Step size] [Unit]</pre>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;"></span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;"><br>
</span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;">I
 was recently working on applications including air volumes and the results in the air region were heavily impacted with and without applying the step limiter.</span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;"><br>
</span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;">Hope
 this will help,</span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;"><br>
</span></p>
<p><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;">Tony<br>
</span></p>
<p><br>
<span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial,
        sans-serif; font-size: 16px; font-style: normal;
        font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal;
        letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
        text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
        widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
        background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
        initial; text-decoration-color: initial;"></span><font size="-2"><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif;
          font-size: 32px; font-style: normal; font-variant-ligatures:
          normal; font-variant-caps: normal; font-weight: 400;
          letter-spacing: normal; orphans: 2; text-align: left;
          text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal;
          widows: 2; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;
          background-color: rgb(255, 255, 255); text-decoration-style:
          initial; text-decoration-color: initial; display: inline
          !important; float: none;"></span></font></p>
<br>
<div class="moz-cite-prefix">On 31/10/18 11:17, Sara Neira Castro wrote:<br>
</div>
<blockquote type="cite" cite="mid:AM4P190MB0098CE8286CF15DE61EA0711A7CD0@AM4P190MB0098.EURP190.PROD.OUTLOOK.COM">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color:
          rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif,
          "EmojiFont", "Apple Color Emoji",
          "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI
          Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;" dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color:
            rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif,
            "EmojiFont", "Apple Color Emoji",
            "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI
            Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;" dir="ltr">
<div>
<div>Dear Gate users,<br>
<br>
We have recently started to use Gate to simulate dose deposition in phantoms/CTs, and we have found some inconsistencies in doses deposited in low  density regions (mainly air) when crosschecking with EGSnrc: doses calculated with Gate are much lower than doses
 calculated with EGSnrc. In the  figure we report PDDs for different energies (photons) in a phantom formed by several layers of material (Water-Air-Water-Lung-Water). Material definitions are identical for Gate and EGS. Doses in water are identical, and doses
 in lung are very similar, but doses in air differ for low energies.  Interestingly, this effect seems to vanish with increasing energy (>1 MeV).
<br>
</div>
<div><br>
We have checked the input thousands of times, and yet we cannot find any explanation. We have tried different Gate physics packages (emstandard_opt3,  emstandard_opt4,penelope ...) and cutoffs (typically 10 keV or below), but the systematic difference is still
 there.  Is there any known limitation of Gate for simulating dose deposition of low energy photons in low density media?, or is it some kind of error in our simulation?. We would be grateful for any suggestion. Below are the main features of the Gate code:
<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div># GEOMETRY<br>
/gate/world/daughters/name     cajaAgua<br>
/gate/world/daughters/insert   box <br>
/gate/cajaAgua/geometry/setXLength 29 cm <br>
/gate/cajaAgua/geometry/setYLength 29 cm <br>
/gate/cajaAgua/geometry/setZLength 30. cm <br>
/gate/cajaAgua/setMaterial Water<br>
<br>
/gate/cajaAgua/daughters/name     aire1<br>
/gate/cajaAgua/daughters/insert   box <br>
/gate/aire1/geometry/setXLength 29 cm <br>
/gate/aire1/geometry/setYLength 29 cm <br>
/gate/aire1/geometry/setZLength 3. cm <br>
/gate/aire1/setMaterial Air<br>
/gate/aire1/placement/setTranslation 0. 0. -10.5 cm <br>
<br>
/gate/cajaAgua/daughters/name     aire2<br>
/gate/cajaAgua/daughters/insert   box <br>
/gate/aire2/geometry/setXLength 29 cm <br>
/gate/aire2/geometry/setYLength 29 cm <br>
/gate/aire2/geometry/setZLength 3. cm <br>
/gate/aire2/setMaterial Lung<br>
/gate/aire2/placement/setTranslation 0 0. -4.5 cm <br>
<br>
<br>
The source consists in a plane of monoenergetic photons which  is located on the front face of the geometry.  The code was run multiple times for several energies (200, 511, 1000 and 3000 keV).
<br>
<br>
# SOURCE<br>
/gate/source/addSource fuente gps <br>
/gate/source/fuente/gps/particle gamma<br>
/gate/source/fuente/gps/energytype Mono<br>
/gate/source/fuente/gps/monoenergy 200 keV<br>
<br>
/gate/source/fuente/gps/type Plane<br>
/gate/source/fuente/gps/shape Rectangle<br>
/gate/source/fuente/gps/halfx 2.5 cm<br>
/gate/source/fuente/gps/halfy 2.5 cm<br>
/gate/source/fuente/gps/centre 0. 0. -15 cm<br>
<br>
/gate/source/fuente/gps/angtype iso<br>
/gate/source/fuente/gps/mintheta 0. deg<br>
/gate/source/fuente/gps/maxtheta 0. deg<br>
/gate/source/fuente/gps/minphi 0. deg<br>
/gate/source/fuente/gps/maxphi 360. deg<br>
<br>
<br>
Thank you very much in advance, <br>
</div>
<div>Sara </div>
</div>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
<br>
<fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset> <br>
<pre wrap="">_______________________________________________
Gate-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></pre>
</blockquote>
<br>
</body>
</html>