<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear Andreas<br><br></div>I am working directly with cluster with linux terminal and it is working but it did not start from the last particles..<br></div>My program was running for 5 * 10 to power of 8 particles and then the terminal was closed accidentally so I have to use continues script.<br></div>When I typed it, the program start from the beginning and do not continue from  5 * 10 to power of 8!!!<br><br><br></div>Best <br></div>Mery<br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, May 9, 2018 at 11:37 AM Andreas Resch <<a href="mailto:andreas.resch@meduniwien.ac.at">andreas.resch@meduniwien.ac.at</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Am 2018-05-09 06:51, schrieb Mery MB:<br>
> Dear Maxime<br>
> <br>
> I try to use your script for continue my program, the below line:<br>
>                                    NOHUP Gate main.mac &But I get this<br>
> line in terminal<br>
>                                   nohup: ignoring input and appending<br>
> output to 'nohup.out'<br>
> and I did see any reaction on my statue file as the program is running<br>
> <br>
> <br>
> or when I type this line: nohup Gate main.mac > OUT.LOG 2>&1 &    I<br>
> got a number like 115509 in terminal that maybe it be the particles<br>
> which was run before...<br>
> <br>
> I wonder if you have time to help me this issue..<br>
> <br>
> Best<br>
> <br>
> Mery<br>
> <br>
> On Thu, Apr 5, 2018 at 12:44 PM Maxime Chauvin<br>
> <<a href="mailto:maxime.chauvin@inserm.fr" target="_blank">maxime.chauvin@inserm.fr</a>> wrote:<br>
> <br>
>> Dear Mery,<br>
>> <br>
>> GATE like any other program launched in a terminal will be kill if<br>
>> it receives some specific signal like SIGHUP (signal hang up) sent<br>
>> when you close a terminal.<br>
>> <br>
>> If you want your program to continue even if you close the terminal,<br>
>> you just need to disregard the signal SIGHUP when you launch GATE<br>
>> (or any other program). To do this you can simply use the command<br>
>> nohup (no hang up):<br>
>> <br>
>> NOHUP Gate main.mac &<br>
>> <br>
>> I recommend also redirecting the standard output and error to a log<br>
>> file so you can see what happened during the execution:<br>
>> <br>
>> nohup Gate main.mac > OUT.LOG 2>&1 &<br>
>> <br>
>> You can use this on your computer as well as on a server over ssh.<br>
>> <br>
>> Kind regards,<br>
>> Maxime<br>
>> <br>
>>> On 5 Apr 2018, at 09:02, Mery MB <<a href="mailto:mery.mb.mph@gmail.com" target="_blank">mery.mb.mph@gmail.com</a>> wrote:<br>
>>> <br>
>>> Dear Gate User<br>
>>> <br>
>>> Is there any way to continue the Gate programs after closing the<br>
>>> terminal with any reason?<br>
>>> <br>
>>> Best<br>
>>> Mery<br>
>>> _______________________________________________<br>
>>> Gate-users mailing list<br>
>>> <a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
>>> <a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br>
> _______________________________________________<br>
> Gate-users mailing list<br>
> <a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
> <a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br>
<br>
<br>
Dear Mery,<br>
<br>
Maxime's suggestions work as they should (at least in bash). Just all <br>
output is redirected to the file nohup.out instead of the terminal <br>
screen. Open a second terminal and use the "top" or the "ps -aux" <br>
command to check if it is still running. Or look at the nohup.out file, <br>
when it was created and what is in there.<br>
<br>
Best,<br>
Andreas<br>
</blockquote></div>