<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:-moz-fixed;
        panose-1:0 0 0 0 0 0 0 0 0 0;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman",serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Hello,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">I would suggest you to try the latest Gate release, to start with some example and complexify them step by step to understand what happens.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">In addition, I would suggest to use steps and cuts always lower than the scoring resolution.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D">Loïc<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0in 0in 0in">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif">From:</span></b><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri",sans-serif"> Gate-users [mailto:gate-users-bounces@lists.opengatecollaboration.org]
<b>On Behalf Of </b>Theodora Kostou<br>
<b>Sent:</b> Friday, August 11, 2017 12:04 PM<br>
<b>To:</b> gate-users@lists.opengatecollaboration.org<br>
<b>Subject:</b> [Gate-users] Dose Calculation interface problem?<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EL" style="font-size:10.5pt;font-family:"-moz-fixed",serif"><br>
Dear GATE users, <br>
<br>
I am trying to use GATE to calculate the effect of a nanoparticle on the depth-dose curve in radiation therapy. As I was getting incorrect results, I scaled up the problem in order to eliminate possible nano-effects. However, even at the mm level, the problem
 still persists. <br>
<br>
It seems to me that there is a problem with geometrical interfaces. Any help would be appreciated.
<br>
<br>
Here is the setup: <br>
<br>
The phantom is a box of water, 20x20x20 mm3 in size. It is irradiated by a 2x2 mm2 square source emitting monoenergetic 140.5 keV photons, placed 2 mm outside the phantom (The small sizes of the phantom and the source are necessary in order to achieve good
 statistics when a nanoparticle is inserted in the phantom). Dose is scored in a 200x200x200 matrix. Each voxel is 0.1x0.1x0.1 mm3.
<br>
<br>
Then, I add a 2mm thick layer of water, placed 5 mm below the surface of the phantom, i.e inside the phantom. The depth-dose curve now exhibits two sharp peaks at the location of the interfaces of the water layer and the water phantom (at 4 and 6 mm).
<br>
<br>
The simulations were run on the VIP platform using GATE v6.2. To narrow down the causes I turned off all physical processes, except the Compton effect.
<br>
<br>
Since physically nothing has changed - we are still dealing with a cube of water - I suspect that the cause of the problem is the mere introduction of a new geometrical volume.
<br>
<br>
Has anyone ever encountered this problem? What are the solutions? <br>
<br>
Thank you, <br>
Theodora<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span lang="EL" style="font-size:10.5pt;font-family:"-moz-fixed",serif"> <o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><small><span style=""><o:p></o:p></span><b><span style="font-family: "Verdana","sans-serif"; color: rgb(17, 35, 89);" lang="EN-GB">Disclaimer:</span></b><br>
<span style="font-family: "Verdana","sans-serif"; color: rgb(17, 35, 89);" lang="EN-GB">Please notice our E-Mail Disclaimer <a href="http://www.medaustron.at/email-disclaimer/"><span style="color: rgb(17, 35, 89);">http://www.medaustron.at/email-disclaimer/</span></a></span></small><span style=""><o:p></o:p></span><o:p> </o:p></p>
</div>
<br>
</body>
</html>