<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;" dir="ltr">
<p><br>
</p>
<br>
<br>
<div style="color: rgb(0, 0, 0);">
<hr style="display:inline-block; width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> maikol salas ramirez <mmsalas@gmail.com><br>
<b>Sent:</b> Monday, 26 June 2017 8:46 p.m.<br>
<b>To:</b> Emmanuel Marfo<br>
<b>Subject:</b> Re: 02 [Gate-users] Dose Actor shows empty results</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>Hi Emmanuel<br>
<br>
</div>
I think, I found the reason, the problem is resolved when you attach the phantom to the scanner, instead to the world.
<br>
</div>
Also I found in the actor a typing error with the pixel size.<br>
<br>
</div>
I did many changes, in the very beginning I try many things because I never expect that the error was related with the attached volume. But in the other hand I improved your physics library to have a better Dose quantification.<br>
</div>
I did some clean and order just to help me to understand. I change your matrix to image file, you can open it using Fiji-ImajeJ. In any case many something can help you to improve your code, I recommend you don use directly my code version, it is better that
 you check and chose what can be useful.<br>
<br>
</div>
If you have a question just ask me.<br>
<br>
</div>
<div>Best regards<br>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div>
<div>
<div> <br>
<div><br>
<div>
<div><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">2017-06-23 11:31 GMT+02:00 Emmanuel Marfo <span dir="ltr">
<<a href="mailto:emmanuel.marfo@postgrad.otago.ac.nz" target="_blank">emmanuel.marfo@postgrad.otago.ac.nz</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex; border-left:1px #ccc solid; padding-left:1ex">
<div>
<div id="m_496377782288431449divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;">
<p>Please Sir</p>
<p>Thanks for your quick response.</p>
<p> I have attached all files for your perusal. However, when I remove all my geometry (tubecase, anode, phantom, applied table and Detectorplane) from the gantry((scanner)(cylinder) and without any rotation o it I am able to score dose.</p>
<p>Best regards,</p>
<p>Emmanuel</p>
</div>
<hr style="display:inline-block; width:98%">
<div id="m_496377782288431449divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> maikol salas ramirez <<a href="mailto:mmsalas@gmail.com" target="_blank">mmsalas@gmail.com</a>><br>
<b>Sent:</b> Friday, 23 June 2017 8:16:32 p.m.<br>
<b>To:</b> Emmanuel Marfo<br>
<b>Subject:</b> 02 [Gate-users] Dose Actor shows empty results</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div class="h5">
<div>
<div dir="ltr">Hi Emmanuel
<div><br>
</div>
<div>As I told you, I work in nuclear medicine. But the principle is the same for your simulation and my simulation, the difference come from the energy spectrum and particles (in my case I simulate electron, photons and alphas). I think that maybe I can help
 you.</div>
<div><br>
</div>
<div>From my point of view, there are some possible problem:<br>
</div>
<div>1- Few particles simulated.</div>
<div>2- Few particles reach the sensible volume (dose actor + phantom)</div>
<div>3- Your dose actor it is no well attached to your phantom (interaction medium - patient or water phantom). Something happen that they are not in the same position, and you have to shift your actor matrix.</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>Can you share with me your actor and geometry files?</div>
<div>I think, it is a easy way to see in detail what is the problem.</div>
</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>Best regards</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">2017-06-23 6:47 GMT+02:00 Emmanuel Marfo <span dir="ltr">
<<a href="mailto:emmanuel.marfo@postgrad.otago.ac.nz" target="_blank">emmanuel.marfo@postgrad.<wbr>otago.ac.nz</a>></span>:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex; border-left:1px solid rgb(204,204,204); padding-left:1ex">
<div dir="ltr">
<div id="m_496377782288431449gmail-m_5115139399652538730divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Calibri, Helvetica, sans-serif, EmojiFont, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", NotoColorEmoji, "Segoe UI Symbol", "Android Emoji", EmojiSymbols;">
<p>Dear Gate-Users,</p>
<p>Please, I am dosimetry and I have imported x-ray energy spectrum and using it to score Dose on PMMA phantom. I placed my source in a rotating cylinder name scanner and is to rotate around the phantom where I have a dose Actor to it. The idea behind the rotating
 cylinder is to simulate a rotating gantry. The rotation of the cylinder and the source and the simulation work successfully but the dose Actors shows empty results. </p>
<p>Please, has anyone experienced this kind problem before and is there something I can do to solve my problem. Thanks.</p>
<p><br>
</p>
<p>Best regards,</p>
<p>Emmanuel Marfo</p>
<p>University of Otago</p>
<p>Student</p>
</div>
</div>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecolla<wbr>boration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollabora<wbr>tion.org/mailman/listinfo/<wbr>gate-users</a><br>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>