<div dir="ltr">Hello, <div><br></div><div>there was an issue with the downloaded data, see explanation in page <a href="https://gitlab.in2p3.fr/david.sarrut/gate-exercices">https://gitlab.in2p3.fr/david.sarrut/gate-exercices</a></div><div>Either use the zip files or clone the git repo with lfs option. <br></div><div><br></div><div>David</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 23, 2017 at 12:17 AM, Akiv Jhirad <span dir="ltr"><<a href="mailto:akivjh@gmail.com" target="_blank">akivjh@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Hi Gate users,</span><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">I'm currently going through the tutorial by dsarrut (<a href="https://dsarrut.gitbooks.io/gate-exercises/content/ex5.html" target="_blank">https://dsarrut.gitbooks.io/g<wbr>ate-exercises/content/ex5.html</a><wbr>) but am unable to run the example properly. </div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Here is the error: </div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">MetaImage: M_ReadElementsData: data not read completely</div><div style="font-size:12.8px">     ideal = 3407872 : actual = 132</div><div style="font-size:12.8px">GateVImageVolume.cc (l.363): The image contains HU indices out of range of the HU range found in data/phantom-HU2mat.txt</div><div style="font-size:12.8px">min, max:-1050, 3001.</div><div style="font-size:12.8px">min, max in image: 0, 31337</div><div style="font-size:12.8px">Abort.</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Does anyone have an idea of how I can decrease the image range or have any other alternatives? Increasing the range of the phantom-HU2mat.txt file did not work since the file is written to during each run with the range -1050, 3001.</div><div><br></div><div><div class="m_-7743841366079885717gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">--</div><div dir="ltr">Best Regards,<div>Akiv Jhirad</div></div></div></div></div></div>
</div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.<wbr>opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.<wbr>opengatecollaboration.org/<wbr>mailman/listinfo/gate-users</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">David Sarrut, Phd<br>Directeur de recherche CNRS<br>CREATIS, UMR CNRS 5220, Inserm U1206<div>Centre de lutte contre le cancer Léon Bérard<br>28 rue Laënnec, 69373 Lyon cedex 08<br>Tel : 04 78 78 51 51 / 06 74 72 05 42<br><a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/~dsarrut</a><br>_________________________________</div><div> "2 + 2 = 5,  for extremely large values of 2"<br>_________________________________</div></div></div></div></div></div></div>
</div>