<div dir="ltr"><div><div>Okay. Awesome. First let me say thanks getting back to me so 
quickly. Getting this program to be fully functional as soon as possible
 is really super important. <br></div>So first off the only thing that 
jumps out at me as not EXACTLY like the instructions is the version of 
CLHEP I'm using is a little different. It says to use 2.3.1.1, and I'm 
using 2.3.3.2. I didn't think it would make that big of a difference, 
but if you think that may be the culprit, I can go back and do it that 
way.<br></div><div>If you don't think that is probably the problem, I am
 including several screen shots of my command screen to show the process
 I'm attempting to use. So if you see any fatal errors I'm making, do 
please let me know.<br></div><div>Thank you again so much for all of your help, and I look forward to hearing from you again soon.<br><br></div>Best regards,</div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><b style="font-size:12.8000001907349px">R. Kevin Wilson</b><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">San Diego State University | <i>2017</i></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Department of Physics | <i>M.S <span style="font-size:12.8000001907349px">Medical Physics</span></i></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Radiation Detection Measuring & Modeling Laboratory</div><div style="font-size:12.8000001907349px"><i>PET/SPECT Modeling - vGate & GEANT4</i></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><img src="https://docs.google.com/uc?export=download&id=0B6r246QLjtCqeXF0R2VyVjFEUWM&revid=0B6r246QLjtCqWVBkRm1qTjE5L09CMDNYRmRaTnhVSG8rcVVFPQ" width="85" height="96"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Clemson University | <i>2015</i></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">College of Engineering & Science</span><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Department of Physics & Astronomy | <i>B.S. Applied Physics</i> </div><div style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">CU EBIT & Atomic Physics Laboratory </span><b style="font-size:12.8000001907349px">|</b><span style="font-size:12.8000001907349px"> </span><i style="font-size:12.8000001907349px">Intern Recipient and Student Researcher</i><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><i></i><i><img src="http://math.msstate.edu/events/reu/reu2011/images/clemson_logo.gif" width="200" height="52"><br></i></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><a href="mailto:rkwilson@mail.sdsu.edu" target="_blank">rkwilson@mail.sdsu.edu</a></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><div><a href="mailto:rkwilso@g.clemson.edu" target="_blank">rkwilso@g.clemson.edu</a><br></div><div>(828) 216-5310</div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Nov 30, 2016 at 2:12 PM, Robert Wilson <span dir="ltr"><<a href="mailto:rkwilson@mail.sdsu.edu" target="_blank">rkwilson@mail.sdsu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Okay. Awesome. First let me say thanks getting back to me so quickly. Getting this program to be fully functional as soon as possible is really super important. <br></div>So first off the only thing that jumps out at me as not EXACTLY like the instructions is the version of CLHEP I'm using is a little different. It says to use 2.3.1.1, and I'm using 2.3.3.2. I didn't think it would make that big of a difference, but if you think that may be the culprit, I can go back and do it that way.<br></div><div>If you don't think that is probably the problem, I am including several screen shots of my command screen to show the process I'm attempting to use. So if you see any fatal errors I'm making, do please let me know.<br></div><div>Thank you again so much for all of your help, and I look forward to hearing from you again soon.<br><br></div><div>Best regards,<br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_9051571029292532620gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span class=""><b style="font-size:12.8000001907349px">R. Kevin Wilson</b><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">San Diego State University | <i>2017</i></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Department of Physics | <i>M.S <span style="font-size:12.8000001907349px">Medical Physics</span></i></div></span><span class=""><div style="font-size:12.8000001907349px">Radiation Detection Measuring & Modeling Laboratory</div></span><span class=""><div style="font-size:12.8000001907349px"><i>PET/SPECT Modeling - vGate & GEANT4</i></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><img src="https://docs.google.com/uc?export=download&id=0B6r246QLjtCqeXF0R2VyVjFEUWM&revid=0B6r246QLjtCqWVBkRm1qTjE5L09CMDNYRmRaTnhVSG8rcVVFPQ" width="85" height="96"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px">Clemson University | <i>2015</i></div></span><span class=""><div style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">College of Engineering & Science</span><br></div></span><span class=""><div style="font-size:12.8000001907349px">Department of Physics & Astronomy | <i>B.S. Applied Physics</i> </div><div style="font-size:12.8000001907349px"><span style="font-size:12.8000001907349px">CU EBIT & Atomic Physics Laboratory </span><b style="font-size:12.8000001907349px">|</b><span style="font-size:12.8000001907349px"> </span><i style="font-size:12.8000001907349px">Intern Recipient and Student Researcher</i><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><br></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><i></i><i><img src="http://math.msstate.edu/events/reu/reu2011/images/clemson_logo.gif" width="200" height="52"><br></i></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><a href="mailto:rkwilson@mail.sdsu.edu" target="_blank">rkwilson@mail.sdsu.edu</a></div><div style="font-size:12.8000001907349px"><div><a href="mailto:rkwilso@g.clemson.edu" target="_blank">rkwilso@g.clemson.edu</a><br></div><div><a href="tel:%28828%29%20216-5310" value="+18282165310" target="_blank">(828) 216-5310</a></div></div></span></div></div></div></div></div></div></div><div><div class="h5">
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Nov 29, 2016 at 1:47 AM, David Boersma <span dir="ltr"><<a href="mailto:david.boersma@physics.uu.se" target="_blank">david.boersma@physics.uu.se</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Robert,<br>
<br>
(Please disregard the mail I sent erroneously only to you, and reply to this one, to the whole mailing list...)<span><br>
<br>
Some basics that may help us to reproduce your problem and/or give you hints for a solution:<br>
<br>
1. what operating system are you on (if linux: which distro, which release)?<br>
<br>
2. which version of Gate are you trying to compile/install?<br>
<br>
Den 28/11/2016 kl. 21:07, skrev Robert Wilson:<br>
</span><span><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I have been following the procedure extremely closely, but when I<br>
attempt to make a path to rootcint with cmake it is unable to create it.<br>
</blockquote>
<br></span><span>
The compilation steps are described in this wiki page:<br>
<br>
<a href="http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Compilation_Instructions_V7.2" rel="noreferrer" target="_blank">http://wiki.opengatecollaborat<wbr>ion.org/index.php/Compilation_<wbr>Instructions_V7.2</a><br>
<br></span>
Is this indeed "the procedure" that you have followed extremely closely?<span><br>
If no: what *did* you use?<br>
<br>
If yes: could you specify where exactly you get stuck, and what you mean by "make a path to rootcint"? Can you quote the error messages? It is better to quote to much than too little.<br>
<br>
Random guess (sorry if I'm completely off): did you run "source /PATH/TO/ROOT/bin/thisroot.sh" (or .csh, if you are a csh user) in the same shell as where you are running ccmake? To test this, just *before* starting the cmake step, issue this command (in the shell):<br>
<br>
which root-config<br>
<br>
If this gives the correct path, then the shell is configured with your favorite ROOT version and cmake should be able to find it. If the answer is empty (or an error) then maybe you should try to source root (again?) before running the cmake step.<br>
<br>
<br>
</span><span><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
All files and directories show that they are in the proper places, and I<br>
am quite confident that the command I am using is correct, but if anyone<br>
else has had this problem I would really appreciate any input on how to<br>
resolve it. This is the final step in having a fully functional Gate<br>
running computer, and I really need it in order to move forward in my<br>
research.<br>
</blockquote>
<br></span>
Unfortunately, I need to warn you here. You *never* really know if a specific compiling problem (or to some bug) is the "final one" until you have explicitly confirmed that fixing that one problem resulted in a correctly running program. Behind the current roadblock many others may still be hiding.<span><br>
<br>
Hope that helps,<br>
David Boersma<br>
<br></span>
PS: You have quite an illustrious name! (I work in proton therapy.)<br>
<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><span>
<br>
Many thanks in advance,<br>
<br>
*R. Kevin Wilson*<br>
<br>
San Diego State University | /2017/<br>
Department of Physics | /M.S Medical Physics/<br></span><span>
Radiation Detection Measuring & Modeling Laboratory<br></span><span>
/PET/SPECT Modeling - vGate & GEANT4/<br>
<br>
<br>
<br>
Clemson University | /2015/<br></span><span>
College of Engineering & Science<br></span><span>
Department of Physics & Astronomy | /B.S. Applied Physics/<br>
CU EBIT & Atomic Physics Laboratory *|* /Intern Recipient and Student<br>
Researcher/<br>
<br>
///<br>
/<br>
<a href="mailto:rkwilson@mail.sdsu.edu" target="_blank">rkwilson@mail.sdsu.edu</a> <mailto:<a href="mailto:rkwilson@mail.sdsu.edu" target="_blank">rkwilson@mail.sdsu.edu</a><wbr>><br>
<a href="mailto:rkwilso@g.clemson.edu" target="_blank">rkwilso@g.clemson.edu</a> <mailto:<a href="mailto:rkwilso@g.clemson.edu" target="_blank">rkwilso@g.clemson.edu</a>><br>
<a href="tel:%28828%29%20216-5310" value="+18282165310" target="_blank">(828) 216-5310</a><br>
<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecolla<wbr>boration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollabora<wbr>tion.org/mailman/listinfo/gate<wbr>-users</a><br>
<br>
</span></blockquote><div class="m_9051571029292532620HOEnZb"><div class="m_9051571029292532620h5">
______________________________<wbr>_________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecolla<wbr>boration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" rel="noreferrer" target="_blank">http://lists.opengatecollabora<wbr>tion.org/mailman/listinfo/gate<wbr>-users</a></div></div></blockquote></div><br></div></div></div>
</blockquote></div><br></div>