<div dir="ltr"><div><div><div>Here in Gate 7.2, I only see<br>/gate/physics/addPhysicsList QGSP_BERT_HP_EMY<br></div>no custom physics macros. Perhaps you can upgrade to the latest version.<br><br></div>Cheers,<br></div>Brent<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2016-06-23 14:06 GMT+02:00 张晖 <span dir="ltr"><<a href="mailto:zhanghui@impcas.ac.cn" target="_blank">zhanghui@impcas.ac.cn</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hello Brent,<div>Thank you for your attention!I simulate carbon pencil beam irradiating water box and research the dose distribution of secondaries in water box.In GATE_v7.1, my physics section is  </div><div>/gate/physics/addPhysicsList QGSP_BERT_HP_EMY</div><div><div>/control/execute mac/physicslist_EM_std.mac</div><div>/control/execute mac/physicslist_HAD_std.ma</div><div><br></div>which are all initial definition in example_Radiotherapy/example1. If it's right,why is the dose distribution of secondaries  all zero?Is there other reason to this?</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Zhang Hui<br><br><blockquote name="replyContent" style="padding-left:5px;margin-left:5px;border-left:#b6b6b6 2px solid;margin-right:0">-----原始邮件-----<br>
<b>发件人:</b> "Brent Huisman" <<a href="mailto:brent.huisman@insa-lyon.fr" target="_blank">brent.huisman@insa-lyon.fr</a>><br>
<b>发送时间:</b> 2016年6月23日 星期四<br>
<b>收件人:</b> <a href="mailto:zhanghui@impcas.ac.cn" target="_blank">zhanghui@impcas.ac.cn</a><br>
<b>抄送:</b> <a href="mailto:gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<b>主题:</b> Re: [Gate-users] question about secondary dose distribution in GATE_v6.2 and GATE_v7.1<div><div class="h5"><br><br><div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hello Zhang Hui,<br><br></div>A major change from Gate 6 to 7 was the ability to include 'prebuilt' reference physicslists from Geant4, which you probably want to do, look here:<br><a href="http://geant4.web.cern.ch/geant4/support/proc_mod_catalog/physics_lists/useCases.shtml" target="_blank">http://geant4.web.cern.ch/geant4/support/proc_mod_catalog/physics_lists/useCases.shtml</a><br></div><div>and here the Gate 7.0 release notes:<br><a href="http://www.opengatecollaboration.org/sites/opengatecollaboration.org/files/GATE-UsersGuideV7.0.pdf" target="_blank">http://www.opengatecollaboration.org/sites/opengatecollaboration.org/files/GATE-UsersGuideV7.0.pdf</a><br></div><div><br></div>Before, you had to compile lists yourself from various types of interactions. If you are working with photons for example, you might not need nuclear interactions, and save time. However, when you shoot particles for which you forgot to include the correct physics, you may end up with empty scorers.<br><br></div>You can still make your own physics (as was done <Gate7), but unless there's a particular reason I would recommend against it and sticking to one of the built-in lists.<br><br></div>Cheers,<br></div><div>Brent<br></div><div><div><div><div><div><div><div><div><br><div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Date: Thu, 23 Jun 2016 09:38:55 +0800 (GMT+08:00)<br>
From: 张晖 <<a href="mailto:zhanghui@impcas.ac.cn" target="_blank">zhanghui@impcas.ac.cn</a>><br>
To: <a href="mailto:gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
Subject: [Gate-users] question about secondary dose distribution in<br>
        GATE_v6.2 and GATE_v7.1<br>
Message-ID: <<a href="mailto:a0f1b8.3dc1a.1557ae8f66d.Coremail.zhanghui@impcas.ac.cn" target="_blank">a0f1b8.3dc1a.1557ae8f66d.Coremail.zhanghui@impcas.ac.cn</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="gbk"<br>
<br>
Dear Gaters,<br>
When I calculate the dose distribution of some secondary,I find that GATE_v6.2 has correct result while GATE_v7.1's result is all zero!The macro file in both versions are the same except physics list.In GATE_v6.2,the physics section is<br>
,<br>
<br>
while in GATE_v7.1,the physics section is<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
and if add two .mac file,it's also OK.Like this,<br>
I'm puzzled these two versions which have different results.If I want to use GATE_v7.1 to calculate the dose distribution of secondary,how do I modify?<br>
<br>
Best regards,<br>
Zhang Hui<br>
<br>
<br>
<br>
--<br>
Zhang Hui<br>
University of Chinese Academy of Sciences<br>
Institute of Modern Physics<br><br></blockquote></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></blockquote><div><div class="h5"><br><span><br>--<br>Zhang Hui<div>University of Chinese Academy of Sciences</div><div>Institute of Modern Physics<br><div><br></div></div></span></div></div></div><br><br><br></blockquote></div><br></div>