<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><style></style></head><body lang=KO link=blue vlink=purple><div class=WordSection1>Hello. Marc.<o:p></o:p>Thank you for your kind advice.<o:p></o:p>I made phantom and detector (for detect x-ray).<o:p></o:p>Here is part of my code.<o:p></o:p><o:p> </o:p># P H A N T O M<o:p></o:p># Create the phantom volume (Plastic)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/world/daughters/name Phantom<o:p></o:p>/gate/world/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Phantom/geometry/setRmax 2 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom/geometry/setHeight 4 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom/placement/setTranslation 0 0 0 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom/placement/setRotationAxis 0 1 0<o:p></o:p>/gate/Phantom/placement/setRotationAngle 90 deg<o:p></o:p>/gate/Phantom/setMaterial Plastic<o:p></o:p>/gate/Phantom/vis/setColor blue<o:p></o:p>/gate/Phantom/vis/forceWireframe<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Made outer cylinder)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom volume (Air for Ce)<o:p></o:p>#<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/name Phantom_Air_1<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/placement/setTranslation 0 1.05 0 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/setMaterial Air<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/vis/setColor blue<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/vis/forceWireframe<o:p></o:p><o:p> </o:p>(First hole in cylinder)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom volume (Air for Gd)<o:p></o:p>#<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/name Phantom_Air_2<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/placement/setTranslation -0.909327 -0.525 0 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/setMaterial Air<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/vis/setColor blue<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/vis/forceWireframe<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Second hole in cylinder)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom volume (Air for W)<o:p></o:p>#<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/name Phantom_Air_3<o:p></o:p>/gate/Phantom/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/placement/setTranslation 0.909327 -0.525 0 cm<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/setMaterial Air<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/vis/setColor blue<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/vis/forceWireframe<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Third hole in cylinder)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom (detector) volume (Ce)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/world/daughters/name Inner_Phantom_1<o:p></o:p>/gate/world/daughters/systemType SPECThead<o:p></o:p>/gate/world/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/placement/setRotationAxis 0 1 0<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/placement/setRotationAngle 90 deg<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/placement/setTranslation 0 1.05 0 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/setMaterial Cerium<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/vis/setColor grey<o:p></o:p><o:p> </o:p>(First detector in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom crystal (detector) volume (Ce)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/daughters/name Inner_Phantom_Crystal_1<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_1/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/placement/setTranslation 0. 0. 0. cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/setMaterial Cerium<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/vis/setColor yellow<o:p></o:p><o:p> </o:p>(First detector crystal in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom (detector) volume (Gd)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/world/daughters/name Inner_Phantom_2<o:p></o:p>/gate/world/daughters/systemType SPECThead<o:p></o:p>/gate/world/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/placement/setRotationAxis 0 1 0<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/placement/setRotationAngle 90 deg<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/placement/setTranslation 0 -0.525 0.909327 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/setMaterial Gadolinium<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/vis/setColor grey<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Second detector in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom crystal (detector) volume (Gd)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/daughters/name Inner_Phantom_Crystal_2<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_2/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/placement/setTranslation 0. 0. 0. cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/setMaterial Gadolinium<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/vis/setColor yellow<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Second detector crystal in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom (detector) volume (W)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/world/daughters/name Inner_Phantom_3<o:p></o:p>/gate/world/daughters/systemType SPECThead<o:p></o:p>/gate/world/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/placement/setRotationAxis 0 1 0<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/placement/setRotationAngle 90 deg<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/placement/setTranslation 0 -0.525 -0.909327 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/setMaterial Tungsten<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/vis/setColor grey<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Third detector in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p>#<o:p></o:p># Create the phantom crystal (detector) volume (W)<o:p></o:p>##<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/daughters/name Inner_Phantom_Crystal_3<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_3/daughters/insert cylinder<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/geometry/setRmax 0.5 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/geometry/setHeight 3.9 cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/placement/setTranslation 0. 0. 0. cm<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/setMaterial Tungsten<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/vis/setColor yellow<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Thihrd detector crystal in cylinder hole)<o:p></o:p><o:p> </o:p><o:p> </o:p><o:p> </o:p><o:p> </o:p># S Y S T E M<o:p></o:p>######<o:p></o:p># The system acts as an interpretor between the GATE geometry and data outputs for reconstruction <o:p></o:p># in our case, the Interfile writer<o:p></o:p># A system must know which components of the geometry are parts of the scanner, and what <o:p></o:p># their role are.<o:p></o:p># For the moment, there is only a system SPECThead, which was built when the SPECThead volume<o:p></o:p># was inserted. <o:p></o:p># The SPECThead system is made of three levels: base (for the head), crystal (for the crystal and crystal matrix) <o:p></o:p># and pixel (for individual crystals for pixellated gamma camera)<o:p></o:p># For now, only the base of the system is attached to a volume: the volume SPECThead<o:p></o:p># For the system to get information about your crystal, the level crystal must be attached to the volume <o:p></o:p># that has been defined for the scintillating crystal (crystal)<o:p></o:p>##<o:p></o:p><o:p> </o:p>#/gate/systems/SPECT_CdTe/crystal/attach Crystal_CdTe<o:p></o:p>##/gate/systems/SPECT_CdTe/describe<o:p></o:p>#/gate/systems/SPECT_CsI/crystal/attach Crystal_CsI<o:p></o:p>##/gate/systems/SPECT_CsI/describe<o:p></o:p><o:p> </o:p>/gate/systems/Inner_Phantom_1/crystal/attach Inner_Phantom_Crystal_1<o:p></o:p>#/gate/systems/Inner_Phantom_1/describe<o:p></o:p>/gate/systems/Inner_Phantom_2/crystal/attach Inner_Phantom_Crystal_2<o:p></o:p>#/gate/systems/Inner_Phantom_2/describe<o:p></o:p>/gate/systems/Inner_Phantom_3/crystal/attach Inner_Phantom_Crystal_3<o:p></o:p>#/gate/systems/Inner_Phantom_3/describe<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Attach crystal to detector)<o:p></o:p><o:p> </o:p><o:p> </o:p># S E N S I T I V E D E T E C T O R S<o:p></o:p>######<o:p></o:p># GATE provides two sensitive detectors, which have two different functions<o:p></o:p># Using them properly is very important for getting accurate results<o:p></o:p>##<o:p></o:p><o:p> </o:p># Crystal SD<o:p></o:p>#<o:p></o:p># The crystal SD makes it possible to record hits in a sensitive volume (e.g.,. in a scintillation crystal)<o:p></o:p># It must be attached to any volume for which hit-data must be obtained<o:p></o:p># For recording hits in the NaI volume only, the name of which is crystal, this volume is attached <o:p></o:p># to the crystal SD<o:p></o:p>##<o:p></o:p><o:p> </o:p>#/gate/Crystal_CdTe/attachCrystalSD<o:p></o:p>#/gate/Crystal_CsI/attachCrystalSD<o:p></o:p><o:p> </o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_1/attachCrystalSD<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_2/attachCrystalSD<o:p></o:p>/gate/Inner_Phantom_Crystal_3/attachCrystalSD<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Attach crystal to detector)<o:p></o:p><o:p> </o:p># Phantom SD<o:p></o:p>#<o:p></o:p># The phantom SD makes it possible to record Compton events in the volumes within the field of view<o:p></o:p># This can provide information for result analysis to discriminate between <o:p></o:p># scattered and unscattered photons<o:p></o:p># It must be attached to each and every volume for whom Compton interactions have to be recorded<o:p></o:p>##<o:p></o:p><o:p> </o:p>/gate/Phantom/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_1/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_2/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/Phantom_Air_3/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/SPECT_CdTe/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/Collimator/attachPhantomSD<o:p></o:p>/gate/SPECT_CsI/attachPhantomSD<o:p></o:p><o:p> </o:p>#/gate/Inner_Phantom_1/attachPhantomSD<o:p></o:p>#/gate/Inner_Phantom_2/attachPhantomSD<o:p></o:p>#/gate/Inner_Phantom_3/attachPhantomSD<o:p></o:p><o:p> </o:p>(Attach phantom to detector)<o:p></o:p><o:p> </o:p>When I simulate by using this code, empty single and hit data are obtained.<o:p></o:p>What is the problem ?? Could you tell me about that ??<o:p></o:p>Thank you.<o:p></o:p><o:p> </o:p><o:p> </o:p><div><div style='border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm'>From: Marc Chamberland [mailto:MarcChamberland@cmail.carleton.ca] Sent: Monday, February 16, 2015 11:18 PM To: 윤창연 Cc: Gate Users Subject: Re: [Gate-users] How to make complicate phantom<o:p></o:p></div></div><o:p> </o:p>Hi, <o:p></o:p><div><o:p> </o:p></div><div>This can all be found in the User’s Guide: <a href="http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Defining_a_geometry#Creating_a_volume">http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Defining_a_geometry#Creating_a_volume</a><o:p></o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div>For example, create a water cylinder (or whatever material you want), then three daughter cylinders (daughters of your main phantom cylinder) made of air.<o:p></o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div>As for detectors: I don’t know what you mean. Detect what? I’m assuming you’re not doing imaging applications (PET or SPECT), so you want to measure dose? Energy spectrum? In any case, you need Actors: <a href="http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Readout_parameters_for_Radiotherapy_applications:_Actors">http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Readout_parameters_for_Radiotherapy_applications:_Actors</a><o:p></o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div>Cheers,<o:p></o:p><div><div><div>Marc<o:p></o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div>__________________________<o:p></o:p></div><div><o:p> </o:p></div><div>Marc Chamberland, MSc<o:p></o:p></div>PhD candidate Department of Physics Carleton University Ottawa (ON)<o:p></o:p></div></div><o:p> </o:p><div><blockquote style='margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt'><div>On Feb 16, 2015, at 03:26, 윤창연 <<a href="mailto:yudoldosa@hanmail.net">yudoldosa@hanmail.net</a>> wrote:<o:p></o:p></div><o:p> </o:p><div>Hello, Gate users.<o:p></o:p>I want to make cylinder phantom with three hole like below figure.<o:p></o:p> <o:p></o:p><image002.png><o:p></o:p> <o:p></o:p>And three detectors are placed in each hole. What can I do ??<o:p></o:p>Thank you.<o:p></o:p>_______________________________________________ Gate-users mailing list <a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a> <a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a><o:p></o:p></div></blockquote></div><o:p> </o:p></div></div></body></html>