<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hi Jasper,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Try the Gate_PET_2_STIR tool: <a href="http://sourceforge.net/projects/gatepet2stir/" class="">http://sourceforge.net/projects/gatepet2stir/</a></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">It can read your Gate macros and generate the STIR header for you.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Or look at a sample header and just fill out the values yourself.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Or use the create_projdata_template utility from STIR.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I hope this helps!</div>
<div class="">
<div apple-content-edited="true" class=""><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; border-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;  ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; " class="">
<div class="">Marc</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">__________________________</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Marc Chamberland, MSc</div>
PhD candidate<br class="">
Department of Physics<br class="">
Carleton University<br class="">
Ottawa (ON)</div>
</span></div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Feb 12, 2015, at 09:38, J.J.M. Kouwenberg <<a href="mailto:j.kouwenberg@erasmusmc.nl" class="">j.kouwenberg@erasmusmc.nl</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">Dear all,<br class="">
<br class="">
I made a lot of progression in GATE the last couple of days, but the final step eludes me. I ran a cylindricalPET simulation and exported the coincidences and singles to a ROOT file (results seemed fine). The ROOT file is converted to a michelogram and a projection
 file (both .s extensions). The issue is that the Filtered Back Projection function in STIR (FBP2D) only takes .hs (header?) files.<br class="">
Is there a way to generate these header files? I can find little information of this subject.<br class="">
<br class="">
Thanks in advance,<br class="">
<br class="">
Jasper J.M. Kouwenberg<br class="">
Medical Physics Graduate student<br class="">
Nuclear Medicine<br class="">
<br class="">
E-mail <a href="mailto:j.kouwenberg@erasmusmc.nl" class="">j.kouwenberg@erasmusmc.nl</a> | Phone +316 2532 9809<br class="">
_______________________________________________<br class="">
Gate-users mailing list<br class="">
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" class="">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br class="">
http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users<br class="">
</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>