<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
Hi Lorena,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">The cuts correspond to a threshold on the production of secondary particles by the specified particle in the specified volume.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">For example, if you set electron cut to 1 cm in the phantom, it means that if an electron's current energy causes it to have a range (I think it might be the CSDA range or something similar) smaller than 1 cm in the phantom (i.e. it will come
 to a complete stop within 1 cm of its current position), then it will stop producing secondary particles (such as bremsstrahlung photons, for example).</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">What value should you use? It depends on your application. For example, if you are doing PET studies, you probably don’t care about the electrons in the phantom. So, to save time on your simulation, you could have a higher cut in your phantom.
 On the other hand, you probably want a small cut in your LSO since you’re interested in simulating the cascade that leads to scintillation light in your crystal.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">So… there are no hard rules. In doubt, run two simulations with different values of the cuts and compare the results (simulation time and actual results).  </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Cheers,<br class="">
<div apple-content-edited="true" class=""><span class="Apple-style-span" style="border-collapse: separate; color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; line-height: normal; orphans: 2; text-align: -webkit-auto; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: 2; word-spacing: 0px; border-spacing: 0px; -webkit-text-decorations-in-effect: none; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;  ">
<div style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; " class="">
<div class="">Marc</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">__________________________</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Marc Chamberland, MSc</div>
PhD candidate<br class="">
Department of Physics<br class="">
Carleton University<br class="">
Ottawa (ON)</div>
</span></div>
<br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On Feb 4, 2015, at 13:16, LORENA VAZQUEZ CANELAS <<a href="mailto:lorena.vazquez@usal.es" class="">lorena.vazquez@usal.es</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="ltr" class=""><span class="">Hello!<br class="">
I'm a Gate newer
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​ and​</div>
I'm doing simulation of Siemens Biograph TruePoint
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​ ​</div>
PET/CT, but I don't k
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​now​</div>
how to set SetCutInRegion in
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​ LSO and ​</div>
</span>​<span class="">Phantom?<br class="">
1cm or 1 mm or other else ? <br class="">
Is there some rules to set this value when do
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​​</div>
other PET simulations?<br class="">
<div class="gmail_default" style="font-family:comic sans ms,sans-serif;font-size:small;display:inline">
​Thank you so much!​</div>
<br class="">
</span>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<div class="">
<div dir="ltr" class="">
<pre class="">LORENA VÁZQUEZ CANELAS<br class="">-- <br class="">LRI - Datación (Despacho Técnicos)<br class="">Calle Espejo, s/n, 37008 - Salamanca (Spain)<br class="">TEL: +34 923 294930 ext:4932 email: <a href="mailto:lorena.vazquez@usal.es" target="_blank" class="">lorena.vazquez@usal.es</a><br class="">web: <a href="http://campus.usal.es/%7Elri/" target="_blank" class="">http://campus.usal.es/~lri/</a></pre>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br class="">
Gate-users mailing list<br class="">
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" class="">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br class="">
http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>