<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META content="text/html; charset=GB2312" http-equiv=Content-Type>
<STYLE>
BLOCKQUOTE {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px; MARGIN-LEFT: 2em
}
OL {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
UL {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
BODY {
        LINE-HEIGHT: 1.5; FONT-FAMILY: Î¢ÈíÑźÚ; COLOR: #000080; FONT-SIZE: 10.5pt
}
</STYLE>

<META name=GENERATOR content="MSHTML 9.00.8112.16561"></HEAD>
<BODY style="MARGIN: 10px">
<DIV>hello, Albert</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I can not get your link file, can you send me your phantom file,</DIV>
<DIV>maybe you have met the trouble what I have met before, </DIV>
<DIV>however, I'm not sure.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>wishes</DIV>
<DIV><SPAN 
style="FONT-STYLE: normal; FONT-FAMILY: Î¢ÈíÑźÚ; COLOR: #000080; FONT-SIZE: 10.5pt; FONT-WEIGHT: normal; TEXT-DECORATION: ">Shelly</SPAN></DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV 
style="BORDER-BOTTOM: medium none; BORDER-LEFT: medium none; PADDING-BOTTOM: 0cm; PADDING-LEFT: 0cm; PADDING-RIGHT: 0cm; BORDER-TOP: #b5c4df 1pt solid; BORDER-RIGHT: medium none; PADDING-TOP: 3pt">
<DIV 
style="PADDING-BOTTOM: 8px; PADDING-LEFT: 8px; PADDING-RIGHT: 8px; BACKGROUND: #efefef; COLOR: #000000; FONT-SIZE: 12px; PADDING-TOP: 8px">
<DIV><B>From:</B> <A 
href="mailto:gate-users-request@lists.opengatecollaboration.org">gate-users-request</A></DIV>
<DIV><B>Date:</B> 2014-10-09 18:17</DIV>
<DIV><B>To:</B> <A 
href="mailto:gate-users@lists.opengatecollaboration.org">gate-users</A></DIV>
<DIV><B>Subject:</B> Gate-users Digest, Vol 101, Issue 11</DIV></DIV></DIV>
<DIV>
<DIV>Send Gate-users mailing list submissions to</DIV>
<DIV>gate-users@lists.opengatecollaboration.org</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit</DIV>
<DIV>http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</DIV>
<DIV>or, via email, send a message with subject or body 'help' to</DIV>
<DIV>gate-users-request@lists.opengatecollaboration.org</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>You can reach the person managing the list at</DIV>
<DIV>gate-users-owner@lists.opengatecollaboration.org</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>When replying, please edit your Subject line so it is more specific</DIV>
<DIV>than "Re: Contents of Gate-users digest..."</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Today's Topics:</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>   1. Voxelized source placement (Albert Hirtl)</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>----------------------------------------------------------------------</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Message: 1</DIV>
<DIV>Date: Thu, 09 Oct 2014 13:07:33 +0200</DIV>
<DIV>From: Albert Hirtl <albert.hirtl@meduniwien.ac.at></DIV>
<DIV>To: gate-users@lists.opengatecollaboration.org</DIV>
<DIV>Subject: [Gate-users] Voxelized source placement</DIV>
<DIV>Message-ID: <54366C75.1050900@meduniwien.ac.at></DIV>
<DIV>Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Dear Coleagues,</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I am having some trouble to correctly position the voxelized source (or </DIV>
<DIV>to define its size??). Somehow, no matter what I do to the Interfile </DIV>
<DIV>(float, unsigned integer, ...), or where I shift it, only half of it is </DIV>
<DIV>present in the simulation. I attached an image of a simulation </DIV>
<DIV>(generated e- are displayed in red) and the original Interfile. The  mhd </DIV>
<DIV>file of the source can be found by following the link:</DIV>
<DIV>https://www.dropbox.com/sh/jttacutgwo3hn4s/AADfPsa0X_7FiPLp3fSwkHSLa?dl=0</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I use the following  code to read the source:</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>/gate/source/addSource source_PET voxel</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/reader/insert interfile</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/interfileReader/translator/insert range</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/interfileReader/rangeTranslator/readTable </DIV>
<DIV>act_range_file_complete_phant.dat</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/interfileReader/rangeTranslator/describe 1</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/interfileReader/readFile </DIV>
<DIV>data/phantom/NEMA_phant_PET_staphan.h33</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/setPosition   -342.132 -342.132 0 mm</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV># e- source for testing</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/gps/particle e-</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/setForcedUnstableFlag true</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/setForcedHalfLife 1 ms</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/gps/energytype Mono</DIV>
<DIV>/gate/source/source_PET/gps/monoenergy 30.00 keV</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>I honestly ran out of ideas what I could be doing wrong. Any help would </DIV>
<DIV>be great.</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Thanks in advance and cheers,</DIV>
<DIV>Albert</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>-- </DIV>
<DIV>Medizinische Universit?t Wien</DIV>
<DIV>Universit?tsklinik f?r Radiologie und Nuklearmedizin</DIV>
<DIV>W?hringer G?rtel 18-20</DIV>
<DIV>1090 Wien</DIV>
<DIV>Austria</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Tel.: +43 (0) 1 / 40400 55450</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>Web:</DIV>
<DIV>http://www.meduniwien.ac.at/user/albert.hirtl</DIV>
<DIV>http://www.meduniwien.ac.at/moccamed/</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>-------------- next part --------------</DIV>
<DIV>A non-text attachment was scrubbed...</DIV>
<DIV>Name: Screenshot_simulation.png</DIV>
<DIV>Type: image/png</DIV>
<DIV>Size: 46037 bytes</DIV>
<DIV>Desc: not available</DIV>
<DIV>URL: <http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/private/gate-users/attachments/20141009/a38f86bf/attachment.png></DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>------------------------------</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>_______________________________________________</DIV>
<DIV>Gate-users mailing list</DIV>
<DIV>Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</DIV>
<DIV>http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</DIV>
<DIV> </DIV>
<DIV>End of Gate-users Digest, Vol 101, Issue 11</DIV>
<DIV>*******************************************</DIV></DIV></BODY></HTML>