<div dir="ltr"><div><div>HI Ana,<br><br></div>(1) For the definition of the SoftTissue (depends on the organ of interest), you would need to find a reference paper with the SoftTissue <br>(brain, liver,....) properties. As an example, in case of optical imaging, I gathered a list of papers: <br><a href="http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Generating_and_tracking_optical_photons#Bibliography">http://wiki.opengatecollaboration.org/index.php/Users_Guide_V7.0:Generating_and_tracking_optical_photons#Bibliography</a><br><br></div><div>What you need depends on the physics you are simulating. <br></div><div><br></div><div>(2) When you have a root output file, you can use the TTree::MakeClass method from ROOT which generates a 
skeleton class designed to loop over the entries of a tree from your 
root file. Some info here: <a href="http://root.cern.ch/download/doc/ROOTUsersGuideHTML/ch12s21.html">http://root.cern.ch/download/doc/ROOTUsersGuideHTML/ch12s21.html</a><br></div><div>and here as well: <a href="http://v-cuplov.net/root-analysis/">http://v-cuplov.net/root-analysis/</a><br><br></div><div>Hope this helps,<br>vesna<br></div><div><br><br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Wed, Oct 22, 2014 at 9:28 AM, Ana Margarida Mota <span dir="ltr"><<a href="mailto:ninimota87@gmail.com" target="_blank">ninimota87@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Hello Gate-users,</div><div dir="ltr"><br></div><div>I wonder If anyone could help me! It was very important!!</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">I have two questions:<br><div><br></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">(1) Does anyone could tell me what is the definition for material 'SoftTissue'  to add to the material txt file?</span><br></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">(2) How can I "read" or "analyse" what is inside root file(output)?</span></div><span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Thank you very much!</span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Regards</span></div></span></div>
</div><br></div>
</div><br></div>
<br>_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br>
<a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br></blockquote></div><br></div></div>