<div>Dear Uwe,</div>
<div>I send you the macro-files I used. I did not produce the root-files.</div>
<div> </div>
<div>Really thank you.</div>
<div>
<div>Kind regards and best wishes,</div>
<div>Leda</div></div>
<div><br> </div>
<div class="gmail_quote">2014-09-10 8:05 GMT+02:00 Pietrzyk, Uwe <span dir="ltr"><<a href="mailto:u.pietrzyk@fz-juelich.de" target="_blank">u.pietrzyk@fz-juelich.de</a>></span>:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT:#ccc 1px solid;MARGIN:0px 0px 0px 0.8ex;PADDING-LEFT:1ex" class="gmail_quote">
<div style="WORD-WRAP:break-word">
<div><br></div>Dear Leda, 
<div><br></div>
<div>could you send me the macro-files (*.mac) you are using</div>
<div>to have a direkt look at the output. Did you also produce</div>
<div>root-files and did you look at the data through ROOT to check</div>
<div>they look consistent?</div>
<div><br></div>
<div>Kind regards and best wishes,</div>
<div><br></div>
<div>Uwe<span><br>
<div>
<div><span>/----------------------------------------------------------------------</span></div>
<div>Prof. Dr. Uwe Pietrzyk<br>Diplom-Physiker<br>Institut für Neurowissenschaften und Medizin / INM-4<br>Forschungszentrum Jülich GmbH<br>52425 Jülich<br>Tel: <a href="tel:%2B49-2461-61%204763" target="_blank" value="+492461614763">+49-2461-61 4763</a><br>Fax: <a href="tel:%2B49-2461-61%202820" target="_blank" value="+492461612820">+49-2461-61 2820</a><br>Mobil: <a href="tel:%2B49-162-103-4871" target="_blank" value="+491621034871">+49-162-103-4871</a><br>eMail: <a href="mailto:U.Pietrzyk@fz-juelich.de" target="_blank">U.Pietrzyk@fz-juelich.de</a><br><a href="http://www.fz-juelich.de/inm/inm-4/DE/Home/home_node.html" target="_blank">http://www.fz-juelich.de/inm/inm-4/DE/Home/home_node.html</a><br>&<br>Bergische Universität Wuppertal<br>Fachbereich C - Physik / D.08.01<br>Gaußstr. 20<br>42097 Wuppertal<br>Tel: <a href="tel:%2B49-%280%29202-439-3523" target="_blank" value="+492024393523">+49-(0)202-439-3523</a><br>Fax: <a href="tel:%2B49-%280%29202-439-2811" target="_blank" value="+492024392811">+49-(0)202-439-2811</a><br>eMail: <a href="mailto:Uwe.Pietrzyk@physik.uni-wuppertal.de" target="_blank">Uwe.Pietrzyk@physik.uni-wuppertal.de</a><br><a href="http://www.medizinphysik.uni-wuppertal.de/" target="_blank">http://www.medizinphysik.uni-wuppertal.de</a><br>----------------------------------------------------------------------/</div></div><br></span>
<div>
<div class="h5">
<div>
<div>On 09 Sep 2014, at 22:58, Leda Lorenzon <<a href="mailto:lorenzon.leda88@gmail.com" target="_blank">lorenzon.leda88@gmail.com</a>> wrote:</div><br>
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<div><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<p style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span lang="EN-US"><font size="3" face="Calibri">Dear Uwe,</font></span></p><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<p style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span lang="EN-US"><font face="Calibri"><font size="3">I’ve just tried to read the projections as you suggested</font><font size="3">, but it doesn’t work. I don’t know which is the problem. </font></font></span></p><font size="3" face="Times New Roman"></font></div>
<div><br></div>
<div>Kind regards and best wishes.</div>
<div>Leda Lorenzon</div></div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">2014-09-06 22:22 GMT+02:00 Pietrzyk, Uwe <span dir="ltr"><<a href="mailto:u.pietrzyk@fz-juelich.de" target="_blank">u.pietrzyk@fz-juelich.de</a>></span>:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT:#ccc 1px solid;MARGIN:0px 0px 0px 0.8ex;PADDING-LEFT:1ex" class="gmail_quote">
<div>
<div><br></div>Dear Leda, 
<div><br></div>
<div>soon, there will be a new EduGATE example called SPECT_To_Reco and from</div>
<div>this example I copy the read me to read the projections with Fiji / ImageJ (See below).</div>
<div><br></div>
<div>I hope it works in your case too.</div>
<div><br></div>
<div>Kind regards and best wishes,,</div>
<div>Uwe</div>
<div><br></div>
<div>---------------</div>
<div>
<div># File: Readme_reco_demo_Fiji.txt</div>
<div># Fiji / ImageJ import of GATE-projections and reconstructed images:</div>
<div><br></div>
<div>-----</div>
<div><br></div>
<div># Projections:</div>
<div><br></div>
<div># use: File -> Import -> raw -> select "file".sin</div>
<div><br></div>
<div># to be taken from .hdr-file</div>
<div># size of projection: 128x128 pixel</div>
<div># No. projections: 60 </div>
<div># -> file contains 60 images of 128x128 pixel (width x height)</div>
<div># unsigned 16 bit integer</div>
<div># littleendian</div>
<div><br></div></div>
<div>———</div>
<div><br></div>
<div><br>
<div>
<div><span>/----------------------------------------------------------------------</span></div>
<div>Prof. Dr. Uwe Pietrzyk<br>Diplom-Physiker<br>Institut für Neurowissenschaften und Medizin / INM-4<br>Forschungszentrum Jülich GmbH<br>52425 Jülich<br>Tel: <a href="tel:%2B49-2461-61%204763" target="_blank" value="+492461614763">+49-2461-61 4763</a><br>Fax: <a href="tel:%2B49-2461-61%202820" target="_blank" value="+492461612820">+49-2461-61 2820</a><br>Mobil: <a href="tel:%2B49-162-103-4871" target="_blank" value="+491621034871">+49-162-103-4871</a><br>eMail: <a href="mailto:U.Pietrzyk@fz-juelich.de" target="_blank">U.Pietrzyk@fz-juelich.de</a><br><a href="http://www.fz-juelich.de/inm/inm-4/DE/Home/home_node.html" target="_blank">http://www.fz-juelich.de/inm/inm-4/DE/Home/home_node.html</a><br>&<br>Bergische Universität Wuppertal<br>Fachbereich C - Physik / D.08.01<br>Gaußstr. 20<br>42097 Wuppertal<br>Tel: <a href="tel:%2B49-%280%29202-439-3523" target="_blank" value="+492024393523">+49-(0)202-439-3523</a><br>Fax: <a href="tel:%2B49-%280%29202-439-2811" target="_blank" value="+492024392811">+49-(0)202-439-2811</a><br>eMail: <a href="mailto:Uwe.Pietrzyk@physik.uni-wuppertal.de" target="_blank">Uwe.Pietrzyk@physik.uni-wuppertal.de</a><br><a href="http://www.medizinphysik.uni-wuppertal.de/" target="_blank">http://www.medizinphysik.uni-wuppertal.de</a><br>----------------------------------------------------------------------/</div></div><br>
<div>
<div>
<div>
<div>On 06 Sep 2014, at 09:47, Leda Lorenzon <<a href="mailto:lorenzon.leda88@gmail.com" target="_blank">lorenzon.leda88@gmail.com</a>> wrote:</div><br></div></div>
<blockquote type="cite">
<div>
<div>
<div dir="ltr"><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<div style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span lang="EN-US"><font size="3" face="Calibri"> </font></span><br></div><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<p style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span lang="EN-US"><font size="3" face="Calibri">Dear Gate-users,</font></span></p><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<p style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><font face="Calibri"><span lang="EN-US"><font size="3">I tried to execute the template macro files </font><span><font size="3"> </font></span><font size="3">provided in the folder /examples/example_ARF. When I execute the macro “useARFTables” I obtain the output image (“benchARFMultiProjections.hdr” </font><span><font size="3"> </font></span><font size="3">and “benchARFMultiProjections.sin” ) but when I try to open it with ImageJ I obtain an image which is not correct. The simulated source is a point one but the output image is not representing a point source. </font></span><span style="LINE-HEIGHT:115%;FONT-SIZE:11.5pt" lang="EN-US">I sent you a screen shots of one projection.</span></font></p><font size="3" face="Times New Roman"></font>
<div style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span style="LINE-HEIGHT:115%;FONT-SIZE:11.5pt" lang="EN-US"><font face="Calibri">Do I make anything wrong?</font></span></div>
<div style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span style="LINE-HEIGHT:115%;FONT-SIZE:11.5pt" lang="EN-US"><font face="Calibri">Please help me.</font></span></div>
<div style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span style="LINE-HEIGHT:115%;FONT-SIZE:11.5pt" lang="EN-US"><font face="Calibri">Leda</font></span></div>
<div style="MARGIN:0cm 0cm 10pt"><span style="LINE-HEIGHT:115%;FONT-SIZE:11.5pt" lang="EN-US"><font face="Calibri"></font></span><br></div><font size="3" face="Times New Roman"></font></div></div></div><span><benchARFMultiProjections.hdr></span><span><benchARFMultiProjections.png></span>_______________________________________________<br>Gate-users mailing list<br><a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org" target="_blank">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><br><a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a></blockquote></div><br></div><br><font size="1" face="Arial"><br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>Forschungszentrum Juelich GmbH<br>52425 Juelich<br>Sitz der Gesellschaft: Juelich<br>Eingetragen im Handelsregister des Amtsgerichts Dueren Nr. HR B 3498<br>Vorsitzender des Aufsichtsrats: MinDir Dr. Karl Eugen Huthmacher<br>Geschaeftsfuehrung: Prof. Dr.-Ing. Wolfgang Marquardt (Vorsitzender),<br>Karsten Beneke (stellv. Vorsitzender), Prof. Dr.-Ing. Harald Bolt,<br>Prof. Dr. Sebastian M. Schmidt<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br>------------------------------------------------------------------------------------------------<br><br></font></div></blockquote></div><br></div></blockquote></div><br></div></div></div></div></blockquote></div><br>