Hi Sebastien,<br><br>Thanks for the answer. But can I get dosimetric information from attachPhantomSD? I thought that only attachVoxelPhantomSD can do that for me on a voxelized basis?<br><br>Cheers,<br>Albert<br><br>JAN Sebastien <sebastien.jan@cea.fr> schrieb:<br><br>
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Hi<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">In any case, use the command line
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">/gate/hof_brain/attachPhantomSD<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">For every navigator types.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Cheers<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Seb<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif";color:windowtext">De :</span></b><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif";color:windowtext"> gate-users-bounces@lists.opengatecollaboration.org [mailto:gate-users-bounces@lists.opengatecollaboration.org]
<b>De la part de</b> Albert Hirtl<br>
<b>Envoyé :</b> mercredi 6 août 2014 13:30<br>
<b>À :</b> gate-users<br>
<b>Objet :</b> Re: [Gate-users] Problem with attachVoxelPhantomSD<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal">Dear Colleagues,<br>
<br>
I think I found  some kind of "solution" to my problem:<br>
<br>
The command<br>
<br>
/gate/hof_brain/attachVoxelPhantomSD <br>
<br>
 works if I use the command <br>
<br>
/gate/world/daughters/insert  regularMatrix<br>
<br>
instead of <br>
<br>
/gate/world/daughters/insert ImageRegularParametrisedVolume <br>
<br>
But when reading the manual for GATE v7.0 "ImageRegularParametrisedVolume " is recommended as far as I understand. I hope that by using "regularMatrix" I  still can conveniently read in CT images and translate HU into materials
<span class="moz-smiley-s1">:-) </span>.<br>
<br>
However, does anybody know whats wrong by using "ImageRegularParametrisedVolume"?<br>
<br>
Cheers,<br>
Albert<br>
<br>
On 05/08/14 15:10, Albert Hirtl wrote:<o:p></o:p></p>
</div>
<blockquote style="margin-top:5.0pt;margin-bottom:5.0pt">
<p class="MsoNormal">Dear Colleagues, <br>
<br>
I am having trouble with "attachVoxelPhantomSD". Basically I want to do the same as outlined in the GATE example for voxelized sources:
<br>
<br>
------- <br>
# V O X E L I Z E D  M A T R I X   H O F F M A N   B R A I N   P H A N T O M <br>
<br>
<br>
/gate/world/daughters/name hof_brain <br>
/gate/world/daughters/insert ImageRegularParametrisedVolume <br>
/gate/hof_brain/geometry/SetImage brain_phantom.h33 <br>
/gate/hof_brain/geometry/setRangeToMaterialFile range_atten_brain.dat <br>
<br>
/gate/hof_brain/placement/setTranslation  0. 0. 0. mm <br>
/gate/hof_brain/placement/setRotationAxis 1 0 0 <br>
/gate/hof_brain/placement/setRotationAngle 0 deg <br>
/gate/hof_brain/attachPhantomSD <br>
----- <br>
<br>
However, instead of using  "attachPhantomSD" I would like to use "attachVoxelPhantomSD" but I get the error:
<br>
<br>
***** COMMAND NOT FOUND </gate/hof_brain/attachVoxelPhantomSD> ***** <br>
<br>
There already have been some posts concerning that matter, but I didn't find a solution. Is there one, or does "attachVoxelPhantomSD"  not work like I expect it to in GATE version 7.0?
<br>
<br>
Help would be greatly appreciated! <br>
<br>
Cheers, <br>
Albert <br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<o:p></o:p></p>
<pre>_______________________________________________<o:p></o:p></pre>
<pre>Gate-users mailing list<o:p></o:p></pre>
<pre><a href="mailto:Gate-users@lists.opengatecollaboration.org">Gate-users@lists.opengatecollaboration.org</a><o:p></o:p></pre>
<pre><a href="http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.opengatecollaboration.org/mailman/listinfo/gate-users</a><o:p></o:p></pre>
</blockquote>
<p class="MsoNormal"><br>
<br>
<br>
<o:p></o:p></p>
<pre>-- <o:p></o:p></pre>
<pre>Medizinische Universität Wien<o:p></o:p></pre>
<pre>Universitätsklinik für Radiologie und Nuklearmedizin<o:p></o:p></pre>
<pre>Währinger Gürtel 18-20<o:p></o:p></pre>
<pre>1090 Wien<o:p></o:p></pre>
<pre>Austria<o:p></o:p></pre>
<pre><o:p> </o:p></pre>
<pre>Tel.: +43 (0) 1 / 40400 55450<o:p></o:p></pre>
<pre><o:p> </o:p></pre>
<pre>Web:<o:p></o:p></pre>
<pre><a href="http://www.meduniwien.ac.at/user/albert.hirtl">http://www.meduniwien.ac.at/user/albert.hirtl</a><o:p></o:p></pre>
<pre><a href="http://www.meduniwien.ac.at/moccamed/">http://www.meduniwien.ac.at/moccamed/</a><o:p></o:p></pre>
</div>