<div dir="ltr">Hello Filipe,<br><br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div link="blue" vlink="purple" lang="EN-GB">
<div>
<p class="MsoNormal"> I want to simulate scintillation photons produced by 511 keV gammas and their optical path through a LYSO scintillator with mirror polished ends and reflective side surfaces. One end of the crystal is coupled to a wavelength-shifting fibre
 (double-cladded BCF-91A fibre), such that crystal and fibre make a 90 degree angle.
</p><p class="MsoNormal">As I am not experienced with Gate (using vGate 2.1), I have many doubts regarding the proper physics and geometry necessary for the simulation, namely of the optical photons path, optical boundaries and fibre geometry. Is there anyone who
 has simulated similar experiments with this kind of fibres, for example in the AxPET project, who can help me out?<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">I’ve already recompiled Gate with optical ON.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">In order to define the reflective surfaces of the crystal, do I need to first define the volumes with the reflective material or is it possible to define the surfaces only with the crystal volume?</p>
</div></div></blockquote><div><br></div><div>If your crystal is the LYSO material, you just need to define your crystal volume with the LYSO material properties in Materials.xml. For the polished ends and reflective surfaces, you define the surfaces with the finish, reflectivity, .... parameters in Surface.xml.<br>
</div><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div link="blue" vlink="purple" lang="EN-GB"><div><p class="MsoNormal"><u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"> Is it necessary to define separate volumes with the different materials of the fibre (core, first clad and 2^nd clad)? In this case, it is a square fibre, so what would be the best way to do it?</p>
</div></div></blockquote><div><br></div><div>For the WLS fiber, you can describe it as one volume or more detailed volumes. I think one volume would be enough as long as you have its properties which are the absorption/emission wls spectra, mixture (in case you use one volume that is a mix of sub components) refractive index, ... <br>
</div><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div link="blue" vlink="purple" lang="EN-GB"><div><p class="MsoNormal">
</p>Are these physics processes enough: Scintillation, PhotoElectric, Compton, GammaConversion, OpticalAbsorption, OpticalWLS, OpticalBoundary ?
</div></div></blockquote><div><br></div><div>You might also need OpticalRayleigh and OpticalMie which are the physics processes related to the optical photon scattering. In that case you would need the Mie and/or Rayleigh scattering lenghts, material anisotropy for Mie scattering. This depends on your crystal and fiber materials. <br>
</div><div><br></div><div>I hope this helps,<br></div><div>vesna<br><br></div><br></div></div></div>