Hi all,<br><br>The shared libraries have to be added to the LD_LIBRARY_PATH variable.<br>Maybe it works in the PATH variable, but it is not appropriated.<br><br>Cheers,<br>Simon<br><br><div class="gmail_quote">2009/9/17 Ida Häggström <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ida.haggstrom@radfys.umu.se">ida.haggstrom@radfys.umu.se</a>&gt;</span><br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">Hi Sebnem,<br>I have no idea about the cluster tools, but I experieced a similar problem (<b>./gjs: error while loading shared libraries: libgjs.so: cannot open shared object file: No such file or directory</b>) when I was running Gate, with a different shared object however. I think you can add the path to your .so-file to your PATH<br>

<br>export PATH=&lt;your path&gt;/gate_v5.0.0/Cluster_Tools/jobsplitter/tmp/Linux-g++/gjs:$PATH<br>or<br>setenv PATH &lt;your path&gt;/gate_v5.0.0/Cluster_Tools/jobsplitter/tmp/Linux-g++/gjs:$PATH<br><br>I&#39;m not sure, but I think it might do the trick! Note that you have to set this variable every time you start a new terminal window...<br>

cheers!<br>Ida<br><br><div class="gmail_quote">2009/9/16 sebnem erturk <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:sebnem.erturk@gmail.com" target="_blank">sebnem.erturk@gmail.com</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div><div></div><div class="h5">
Hi All,<br><br>We are trying to use the Cluster_Tool package of GATE. Currently we are using  version 4.0.0.<br><br>Checking the file GNUmakefile we see this compilation options<br>DEFAULT_PLATFORM := openmosix<br>
#DEFAULT_PLATFORM := condor<br>
#DEFAULT_PLATFORM := openPBS<br>
<br>
Our aim is to run the clustered version of Gate without using any of the platforms mentioned above. Is this possible or we can run Cluster tools  only one of  those platforms?<br><br>Also, after compiling the jobsplitter tool and trying to execute it we got the following error message:<br>


<br><b>./gjs: error while loading shared libraries: libgjs.so: cannot open shared object file: No such file or directory</b><br><br>We tried also to move the gjs file into the bin directory of main Gate executable but the result is the same. Which place that we have to put the gjs executable?<br>


<br>Also we noticed that the file  libgjs.so is inside the /tmp folder of the jobsplitter directory. <br><br>Do we have to move it by ourself?<br><br>Thanks for your any kind of information in advance.<br><br>Regards,<br clear="all">


<br>-- <br><font color="#888888">Sebnem Erturk<br>University of Pisa<br>Applied Physics Dpt.<br>Largo Pontecorvo<br>56127 Pisa-Italy<br>Office :0039 050 2214346<br>Mobile :0039 345 3331440<br><a href="http://www.df.unipi.it/%7Efiig/" target="_blank">http://www.df.unipi.it/~fiig/</a><br>




</font><br></div></div>_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.healthgrid.org" target="_blank">Gate-users@lists.healthgrid.org</a><br>
<a href="http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>
<br>_______________________________________________<br>
Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.healthgrid.org">Gate-users@lists.healthgrid.org</a><br>
<a href="http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>