Dear all users,<br><br>I am a beginner in GATE. <br>(CLHEP 2.0.3.2 / Geant4 9.1 / root 5.22 / gate4.0.0)<br><br>&nbsp;I am trying to obtain sinogram data from "PET_Ecat_System.mac" example.<br>--------------------------next part-------------------------<br>*************************************************************<br>&nbsp;Geant4 version Name: geant4-09-01-patch-02&nbsp;&nbsp;&nbsp; (9-May-2008)<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Copyright : Geant4 Collaboration<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Reference : NIM A 506 (2003), 250-303<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; WWW : http://cern.ch/geant4<br>*************************************************************<br><br>Visualization Manager instantiating...<br>Visualization Manager initialising...<br>Registering graphics systems...<br><br>You have successfully registered the following graphics systems.<br>Current available graphics systems are:<br>&nbsp; ASCIITree (ATree)<br>&nbsp; DAWNFILE (DAWNFILE)<br>&nbsp; G4HepRep (HepRepXML)<br>&nbsp; G4HepRepFile (HepRepFile)<br>&nbsp; RayTracer (RayTracer)<br>&nbsp; VRML1FILE (VRML1FILE)<br>&nbsp; VRML2FILE (VRML2FILE)<br>&nbsp; OpenGLImmediateX (OGLIX)<br>&nbsp; OpenGLStoredX (OGLSX)<br>&nbsp; RayTracerX (RayTracerX)<br><br>Registering model factories...<br><br>You have successfully registered the following model factories.<br>Registered model factories:................................................<br>...........................................................................<br>...........................................................................<br><br>GATE object:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'digitizer/Coincidences'<br>Is enabled?&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Yes<br>Coincidence window: 10 ns<br>Coincidence window jitter: 0 ps<br>Coincidence offset: 0 ps<br>Coincidence offset jitter: 0 ps<br>Min sector diff.:&nbsp;&nbsp; 2<br>Input:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'Singles'<br>Output:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'Coincidences'<br><br>GATE object:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'digitizer/delay'<br>Is enabled?&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Yes<br>Coincidence window: 10 ns<br>Coincidence window jitter: 0 ps<br>Coincidence offset: 500 ns<br>Coincidence offset jitter: 0 ps<br>Min sector diff.:&nbsp;&nbsp; 2<br>Input:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'Singles'<br>Output:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'delay'<br><br>GATE object:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'digitizer/finalCoinc'<br>Is enabled?&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Yes<br>Nb of elements:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>Attached to:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'digitizer'<br>Output:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 'finalCoinc'<br><br>Output module: 'sinogram'<br>&nbsp;&gt;&gt; Job:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; build a set of 2D sinograms from a PET simulation<br>&nbsp;&gt;&gt; Is enabled ?&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Yes<br>&nbsp;&gt;&gt; Number of crystals per crystal ring: 0<br>&nbsp;&gt;&gt; Number of crystal rings:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&gt;&gt; Number of radial sinogram bins:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&gt;&gt; Filled ?&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; No<br>&nbsp;&gt;&gt; Attached to system:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; systems/ecat<br>***** COMMAND NOT FOUND &lt;/gate/output/ecat7/setFileName yourSinogram&gt; *****<br><br>***** Batch is interupted!! *****<br>---------------------------------------------------------------------------------------------------<br><br>My environment is set as follows:<br>**************************************************************************<br>export G4VERSION=9.1<br>export G4INSTALL=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/geant4.9.1.p02<br>export LMF_HOME=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/lmf_v3.0<br>export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/root_v5.22.00h/root/lib:/usr/local/gate/gate_v4.0.0/CLHEP-2.0.3.2/lib:/usr/local/gate/gate_v4.0.0/gate_v4.0.0/tmp/Linux-g++/Gate:/usr/local/gate/gate_v4.0.0/ECAT/lib:${LD_LIBRARY_PATH}<br>export PATH=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/root_v5.22.00h/root/bin:/usr/local/gate/gate_v4.0.0/gate_v4.0.0/bin/Linux-g++:${PATH}<br>export GATEHOME=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/gate_v4.0.0<br>export ROOTSYS=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/root_v5.22.00h/root<br>export ECAT7_HOME=/usr/local/gate/gate_v4.0.0/ECAT<br>***************************************************************************<br>and the 'libecat.a' file is in the '/usr/local/gate/gate_v4.0.0/ECAT/lib/Linux-g++'.<br>I don't know where is the error, who can help me?<br>thanks<br>lijunlu<br>Southern Medical University ,China<br>ljlubme@163.com <br>&nbsp;<br><br><br><br><span title="neteasefooter"/><hr/>
<a href="http://www.yeah.net/?from=footer">没有广告的终身免费邮箱,www.yeah.net</a>
</span>