Hi,<br><br>If I understand your problem, you are trying to get coincidences with some SPECT device ?? sounds weird ...<br><br>And to analyse your .root file, see the examples in the 2 benchmarks (SPECT: without coincidences, and PET: with coincidences).<br>
There are 2 .C files that contains C++ code that is interpreted by the root software. See the ROOT documentation if necessary but it is <span class="clickable" onclick="dr4sdgryt(event,&quot;Ox&quot;)">disheartening as there are more than 500 pages... Just looking in the example files is sufficient.</span><br>
<br><div class="gmail_quote">2009/5/1  <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:e.pasca@nki.nl">e.pasca@nki.nl</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Did you compile Gate linking it with ROOT libraries?<br>
if so you should have the commands<br>
/gate/output/root<br>
</blockquote><div><br>ROOT is of course properly installed if he can get a root output file with some trees inside.<br>The command related to coincidences is just <span onclick="dr4sdgryt(event)">unavailable when using SPECT system.<br>
<br>Simon<br></span>&nbsp;</div><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"><br>
Edoardo<br>
<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:gate-users-bounces@lists.healthgrid.org">gate-users-bounces@lists.healthgrid.org</a> [<a href="mailto:gate-users-bounces@lists.healthgrid.org">gate-users-bounces@lists.healthgrid.org</a>] On Behalf Of icecreamdbb [<a href="mailto:icecreamdbb@126.com">icecreamdbb@126.com</a>]<br>

Sent: Thursday, April 30, 2009 4:57 AM<br>
To: <a href="mailto:gate-users@lists.healthgrid.org">gate-users@lists.healthgrid.org</a><br>
Subject: [Gate-users] the problems of run the Gate macros<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
Hi,Gate users !<br>
I get three problems after I run the examples given by Gate.<br>
Take SPECT.mac for example ,the problems is<br>
1 It never runs to the end automatically . It &nbsp;always &nbsp;tells &nbsp;&quot;Time set to (s) 600<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
G4PhysicalVolumeModel::Validate() called.<br>
 &nbsp;Volume of the same name and copy number (&quot;world_P&quot;, copy 0) still exists and is being used.<br>
 &nbsp;WARNING: This does not necessarily guarantee it&#39;s the same<br>
 &nbsp;volume you originally specified in /vis/scene/add/.<br>
unexpected character after line continuation character<br>
<br>
*** G4Exception: Aborting execution ***<br>
Abort &quot;<br>
So ,it has no output files . However , I can use another way to input the rest of &nbsp;macros by myself, so it has outputs .<br>
But I wonder why it never runs to the end .<br>
2 &nbsp;The userguide says &quot; &nbsp; The ROOT Object Browser when opening the GATE output file, containing : 4 histograms and 4 trees (GATE, COINCIDENCES, HITS and SINGLES) in which several variables are stored .&quot; But mine have no coincidences . Besides that , when I enter /gate/output/root/setRootCoincidencesFlag 0 , it tells command not find . When install Gate ,I follow the installationGuide ,so I don&#39;t know the reason .<br>

3 &nbsp;Who &nbsp;can &nbsp;tell &nbsp;me the root macros which can open Gate out files .How can I see or analysis the data in file.root ?<br>
 &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Waiting for your answers ! Thank you very much !<br>
<br>
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</div></div>网易邮箱,中国第一大电子邮件服务商&lt;<a href="http://email.163.com" target="_blank">http://email.163.com</a>&gt;<br>
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Gate-users mailing list<br>
<a href="mailto:Gate-users@lists.healthgrid.org">Gate-users@lists.healthgrid.org</a><br>
<a href="http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users" target="_blank">http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users</a><br>
</blockquote></div><br>