<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1"> <html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"> <head> <meta name=Generator content="Microsoft Word 12 (filtered medium)">  <style>  </style>  </head> <body lang=PT link=blue vlink=purple> <div class=Section1> Hi Sonal!<o:p></o:p> <o:p> </o:p> I agree with Nicolas!<o:p></o:p> I had similar problems due to some incompatibilities between GATE versions and the ROOT framework.<o:p></o:p> Check your installation versions!!<o:p></o:p> <o:p> </o:p> Cheers,<o:p></o:p> <o:p> </o:p> Susana Branco Silva<o:p></o:p> <o:p> </o:p> <img width=239 height=35 id="Picture_x0020_1" src="cid:image001.gif@01C8BDFB.813B5790" alt=untitled><o:p></o:p> Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa<o:p></o:p> Campo Grande, 1749-016 Lisboa, Portugal Phone: (+351) 21 750 01 77 ext.: 20515 Fax:  (+351) 21 750 00 30<o:p></o:p> <a href="mailto:susana.silva@fc.ul.pt">email: susana.silva@fc.ul.pt</a><o:p></o:p> url: <a href="www.ibeb.fc.ul.pt">www.ibeb.fc.ul.pt</a><o:p></o:p> <o:p> </o:p> -----Original Message----- From: gate-users-bounces@lists.healthgrid.org [mailto:gate-users-bounces@lists.healthgrid.org] On Behalf Of Nicolas Karakatsanis Sent: sábado, 24 de Maio de 2008 17:41 To: Sonal Ambwani; gate-users@lists.healthgrid.org Subject: Re: [Gate-users] Re: Gate-users Digest, Vol 24, Issue 31<o:p></o:p> <o:p> </o:p> Hi Sonal,<o:p></o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> for the current version of GATE (3.1.2), the recommended version of ROOT <o:p></o:p> is 5.14. You can find this ROOT distribution at the following link<o:p></o:p> http://root.cern.ch/root/Version514.html<o:p></o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> The error message generated by GATE suggests that the problem is caused <o:p></o:p> by an incompatibility between the GATE and the ROOT versions that are <o:p></o:p> installed on your system.<o:p></o:p> Therefore it is most likely that the problem will be solved when you <o:p></o:p> install this particular ROOT distribution.<o:p></o:p> GATE had been tested with this version and no error messages of this <o:p></o:p> nature were reported.<o:p></o:p> <o:p> </o:p> Please let us know about the outcome of your GATE simulations after <o:p></o:p> installing ROOT 5.14<o:p></o:p> <o:p> </o:p> Best regards<o:p></o:p> Nicolas<o:p></o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> _____________________________________________________<o:p></o:p> Nicolas Karakatsanis<o:p></o:p> PhD Candidate<o:p></o:p> Biomedical Simulations and Imaging Technologies Laboratory<o:p></o:p> School of Electrical and Computer Engineer<o:p></o:p> National Technical University of Athens, Greece<o:p></o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> <o:p> </o:p> Sonal Ambwani wrote:<o:p></o:p> > Thanks Jose,<o:p></o:p> > The thought of reinstalling root occured to me too. Could you tell me <o:p></o:p> > which version of root you are using? I have 5.18 right now and it is <o:p></o:p> > causing issues with the digitizer module it seems.<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> > Quoting José Ramos <joserm84@gmail.com>:<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> >> Hi Sonal<o:p></o:p> >> I had a similar problem, I solved it, "reinstalling root" and recompile<o:p></o:p> >> Gate<o:p></o:p> >> I hope this help<o:p></o:p> >> Best regards<o:p></o:p> >> 2008/5/24 <gate-users-request@lists.healthgrid.org>:<o:p></o:p> >><o:p> </o:p> >>> Send Gate-users mailing list submissions to<o:p></o:p> >>> gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<o:p></o:p> >>> http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> >>> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<o:p></o:p> >>> gate-users-request@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> You can reach the person managing the list at<o:p></o:p> >>> gate-users-owner@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<o:p></o:p> >>> than "Re: Contents of Gate-users digest..."<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Today's Topics:<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> 1. Gate digitizer error (Sonal Ambwani)<o:p></o:p> >>> 2. Re: Gate digitizer error (Sonal Ambwani)<o:p></o:p> >>> 3. Re: Gate digitizer error---update (Sonal Ambwani)<o:p></o:p> >>> 4. Re: Transmission tomography (Javier Serrano)<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ----------------------------------------------------------------------<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Message: 1<o:p></o:p> >>> Date: Fri, 23 May 2008 12:04:26 -0400<o:p></o:p> >>> From: Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu><o:p></o:p> >>> Subject: [Gate-users] Gate digitizer error<o:p></o:p> >>> To: gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> Message-ID: <20080523120426.q8daye1hws4k4ckw@www.bu.edu><o:p></o:p> >>> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; format="flowed"<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Dear Gate-users,<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> I am suddenly getting the following error while running <o:p></o:p> >>> benchmarkSPECT :<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/physics/setXRayCut 200. keV<o:p></o:p> >>> /gate/physics/setElectronCut 1. km<o:p></o:p> >>> /gate/physics/setDeltaRayCut 1. GeV<o:p></o:p> >>> /run/initialize<o:p></o:p> >>> WARNING !<o:p></o:p> >>> SetCutValueForOthers became obsolete.<o:p></o:p> >>> It is harmless to remove this invokation without any side effects.<o:p></o:p> >>> This dummy method implementation will be removed soon.<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert adder<o:p></o:p> >>> ***** COMMAND NOT FOUND </gate/digitizer/Singles/insert adder> *****<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ***** Batch is interupted!! *****<o:p></o:p> >>> Idle><o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Can someone please point out what might be wrong. This was working till<o:p></o:p> >>> a few days ago.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> Boston University<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ------------------------------<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Message: 2<o:p></o:p> >>> Date: Fri, 23 May 2008 12:34:14 -0400<o:p></o:p> >>> From: Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu><o:p></o:p> >>> Subject: Re: [Gate-users] Gate digitizer error<o:p></o:p> >>> To: gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> Message-ID: <20080523123414.rtnx27xw0c04sog0@www.bu.edu><o:p></o:p> >>> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; format="flowed"<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Hi again,<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> I am getting the same error for benchmarkPET. I guess it might help to<o:p></o:p> >>> mention the macro here:<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ###GATE : benchmarkPET.mac<o:p></o:p> >>> /gate/world/geometry/setXLength 150. cm<o:p></o:p> >>> /gate/world/geometry/setYLength 150. cm<o:p></o:p> >>> /gate/world/geometry/setZLength 150. cm<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /control/execute camera.mac<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /control/execute phantom.mac<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /control/execute physics.mac<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> # I N I T I A L I Z E<o:p></o:p> >>> /gate/systems/cylindricalPET/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/geometry/enableAutoUpdate<o:p></o:p> >>> /run/initialize<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert adder<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert readout<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/readout/setDepth 1<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert blurring<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/blurring/setResolution 0.26<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/blurring/setEnergyOfReference 511. keV<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert thresholder<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/thresholder/setThreshold 350. keV<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/insert upholder<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Singles/upholder/setUphold 650. keV<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> # C O I N C I S O R T E R<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Coincidences/setWindow 120. ns<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/Coincidences/MultiplesPolicy takeWinnerOfGoods<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/digitizer/name delay<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/insert coincidenceSorter<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/delay/setWindow 120. ns<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/delay/setOffset 500. ns<o:p></o:p> >>> /gate/digitizer/delay/MultiplesPolicy takeWinnerOfGoods<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /control/verbose 0<o:p></o:p> >>> /grdm/verbose 0<o:p></o:p> >>> /run/verbose 0<o:p></o:p> >>> /event/verbose 0<o:p></o:p> >>> /tracking/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/application/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/generator/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/stacking/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/event/verbose 0<o:p></o:p> >>> /gate/source/verbose 0<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /control/execute sources.mac<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> # O U T P U T<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/output/verbose 0<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/output/ascii/setOutFileHitsFlag 1<o:p></o:p> >>> /gate/output/ascii/setOutFileSinglesFlag 1<o:p></o:p> >>> /gate/output/ascii/setOutFileCoincidencesFlag 1<o:p></o:p> >>> /gate/output/ascii/setOutFiledelayFlag 1<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> /gate/output/root/setFileName benchmarkPET<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setRootHitFlag 0<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setRootSinglesFlag 0<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setRootCoincidencesFlag 1<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setRootdelayFlag 1<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setRootNtupleFlag 0<o:p></o:p> >>> /gate/output/root/setSaveRndmFlag 0<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> # S T A R T<o:p></o:p> >>> /gate/application/setTimeSlice 120. s<o:p></o:p> >>> /gate/application/setTimeStart 0. s<o:p></o:p> >>> /gate/application/setTimeStop 240. s<o:p></o:p> >>> /gate/application/startDAQ<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Quoting Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu>:<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> > Dear Gate-users,<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > I am suddenly getting the following error while running <o:p></o:p> >>> benchmarkSPECT :<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/physics/setXRayCut 200. keV<o:p></o:p> >>> > /gate/physics/setElectronCut 1. km<o:p></o:p> >>> > /gate/physics/setDeltaRayCut 1. GeV<o:p></o:p> >>> > /run/initialize<o:p></o:p> >>> > WARNING !<o:p></o:p> >>> > SetCutValueForOthers became obsolete.<o:p></o:p> >>> > It is harmless to remove this invokation without any side effects.<o:p></o:p> >>> > This dummy method implementation will be removed soon.<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert adder<o:p></o:p> >>> > ***** COMMAND NOT FOUND </gate/digitizer/Singles/insert adder> *****<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > ***** Batch is interupted!! *****<o:p></o:p> >>> > Idle><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Can someone please point out what might be wrong. This was working <o:p></o:p> >>> till<o:p></o:p> >>> > a few days ago.<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> > Boston University<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > _______________________________________________<o:p></o:p> >>> > Gate-users mailing list<o:p></o:p> >>> > Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> > http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> Boston University<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ------------------------------<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Message: 3<o:p></o:p> >>> Date: Fri, 23 May 2008 13:53:17 -0400<o:p></o:p> >>> From: Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu><o:p></o:p> >>> Subject: Re: [Gate-users] Gate digitizer error---update<o:p></o:p> >>> To: gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> Message-ID: <20080523135317.uly9soqzc4c8s840@www.bu.edu><o:p></o:p> >>> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1; format="flowed"<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> benchmarkPET.mac works after disabling the root output completely.<o:p></o:p> >>> Please help!<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Quoting Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu>:<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> > Hi again,<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > I am getting the same error for benchmarkPET. I guess it might <o:p></o:p> >>> help to<o:p></o:p> >>> > mention the macro here:<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > ###GATE : benchmarkPET.mac<o:p></o:p> >>> > /gate/world/geometry/setXLength 150. cm<o:p></o:p> >>> > /gate/world/geometry/setYLength 150. cm<o:p></o:p> >>> > /gate/world/geometry/setZLength 150. cm<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /control/execute camera.mac<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /control/execute phantom.mac<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /control/execute physics.mac<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > # I N I T I A L I Z E<o:p></o:p> >>> > /gate/systems/cylindricalPET/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/geometry/enableAutoUpdate<o:p></o:p> >>> > /run/initialize<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert adder<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert readout<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/readout/setDepth 1<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert blurring<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/blurring/setResolution 0.26<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/blurring/setEnergyOfReference 511. keV<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert thresholder<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/thresholder/setThreshold 350. keV<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/insert upholder<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Singles/upholder/setUphold 650. keV<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > # C O I N C I S O R T E R<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Coincidences/setWindow 120. ns<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/Coincidences/MultiplesPolicy takeWinnerOfGoods<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/name delay<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/insert coincidenceSorter<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/delay/setWindow 120. ns<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/delay/setOffset 500. ns<o:p></o:p> >>> > /gate/digitizer/delay/MultiplesPolicy takeWinnerOfGoods<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /control/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /grdm/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /run/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /event/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /tracking/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/application/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/generator/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/stacking/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/event/verbose 0<o:p></o:p> >>> > /gate/source/verbose 0<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /control/execute sources.mac<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > # O U T P U T<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/output/verbose 0<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/output/ascii/setOutFileHitsFlag 1<o:p></o:p> >>> > /gate/output/ascii/setOutFileSinglesFlag 1<o:p></o:p> >>> > /gate/output/ascii/setOutFileCoincidencesFlag 1<o:p></o:p> >>> > /gate/output/ascii/setOutFiledelayFlag 1<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setFileName benchmarkPET<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setRootHitFlag 0<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setRootSinglesFlag 0<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setRootCoincidencesFlag 1<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setRootdelayFlag 1<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setRootNtupleFlag 0<o:p></o:p> >>> > /gate/output/root/setSaveRndmFlag 0<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > # S T A R T<o:p></o:p> >>> > /gate/application/setTimeSlice 120. s<o:p></o:p> >>> > /gate/application/setTimeStart 0. s<o:p></o:p> >>> > /gate/application/setTimeStop 240. s<o:p></o:p> >>> > /gate/application/startDAQ<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Quoting Sonal Ambwani <ambwani@bu.edu>:<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> >> Dear Gate-users,<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> I am suddenly getting the following error while running <o:p></o:p> >>> benchmarkSPECT :<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> /gate/physics/setXRayCut 200. keV<o:p></o:p> >>> >> /gate/physics/setElectronCut 1. km<o:p></o:p> >>> >> /gate/physics/setDeltaRayCut 1. GeV<o:p></o:p> >>> >> /run/initialize<o:p></o:p> >>> >> WARNING !<o:p></o:p> >>> >> SetCutValueForOthers became obsolete.<o:p></o:p> >>> >> It is harmless to remove this invokation without any side effects.<o:p></o:p> >>> >> This dummy method implementation will be removed soon.<o:p></o:p> >>> >> /gate/digitizer/Singles/insert adder<o:p></o:p> >>> >> ***** COMMAND NOT FOUND </gate/digitizer/Singles/insert adder> *****<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> ***** Batch is interupted!! *****<o:p></o:p> >>> >> Idle><o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> Can someone please point out what might be wrong. This was <o:p></o:p> >>> working till<o:p></o:p> >>> >> a few days ago.<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> >> Boston University<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> >> _______________________________________________<o:p></o:p> >>> >> Gate-users mailing list<o:p></o:p> >>> >> Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> >> http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> >>> >><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> > Boston University<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > _______________________________________________<o:p></o:p> >>> > Gate-users mailing list<o:p></o:p> >>> > Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> > http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Sonal Ambwani<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> >>> Boston University<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ------------------------------<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Message: 4<o:p></o:p> >>> Date: Fri, 23 May 2008 19:51:50 +0200<o:p></o:p> >>> From: "Javier Serrano" <fjaviersr@usal.es><o:p></o:p> >>> Subject: Re: [Gate-users] Transmission tomography<o:p></o:p> >>> To: gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> Message-ID:<o:p></o:p> >>> <89978e4d0805231051m2239f53ci102cb532b02309c3@mail.gmail.com><o:p></o:p> >>> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> > Richard Taschereau wrote:<o:p></o:p> >>> > While it is technically possible to simulate an x-ray CT, the <o:p></o:p> >>> amount of<o:p></o:p> >>> photons you would need is prohibitive.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Yes, I think so too. I did try to simulate this with Geant4 some time<o:p></o:p> >>> ago and I found this problem.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> > Franca Cassol-Brunner wrote:<o:p></o:p> >>> > this will be available in the next Gate release, where a CT system <o:p></o:p> >>> will<o:p></o:p> >>> be<o:p></o:p> >>> > added.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> This is very interesting for me, especially if the next release is<o:p></o:p> >>> coming soon. I would like to simulate a CT system with Gate even with<o:p></o:p> >>> a limited number of photons or projections. I will keep waiting for<o:p></o:p> >>> the next release.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> Thank you all.<o:p></o:p> >>> Greetings, Javi.<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> 2008/5/22 Franca Cassol-Brunner <cassol@cppm.in2p3.fr>:<o:p></o:p> >>> > Javier Serrano wrote:<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> >> Is it possible to use Gate to simulate an x-ray scanner with an<o:p></o:p> >>> >> external cone-beam source?<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Hello Javier,<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > this will be available in the next Gate release, where a CT system <o:p></o:p> >>> will<o:p></o:p> >>> be<o:p></o:p> >>> > added. With the present release you can simulate the cone beam <o:p></o:p> >>> source but<o:p></o:p> >>> > there is no adapted output for the CT images.<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Don't hesitate to contact me directly to get more details.<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Cheers<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > Franca<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>> > ****************************************************<o:p></o:p> >>> > Dr. F. Cassol Brunner<o:p></o:p> >>> > CPPM/IN2P3 (CNRS) Office: 305<o:p></o:p> >>> > 163, Avenue de Luminy Phone : (+33) 491827248<o:p></o:p> >>> > 13288, Marseille Fax : (+33) 491827299<o:p></o:p> >>> > France<o:p></o:p> >>> > ****************************************************<o:p></o:p> >>> ><o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> ------------------------------<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>> _______________________________________________<o:p></o:p> >>> Gate-users mailing list<o:p></o:p> >>> Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> >>> http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >>><o:p> </o:p> >>> End of Gate-users Digest, Vol 24, Issue 31<o:p></o:p> >>> ******************************************<o:p></o:p> >>><o:p> </o:p> >><o:p> </o:p> >><o:p> </o:p> >><o:p> </o:p> >> -- <o:p></o:p> >> e- + e+ -> ~~><o:p></o:p> >><o:p> </o:p> ><o:p> </o:p> ><o:p> </o:p> ><o:p> </o:p> > Sonal Ambwani<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> > Dept. of Electrical and Computer Engineering<o:p></o:p> > Boston University<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> > _______________________________________________<o:p></o:p> > Gate-users mailing list<o:p></o:p> > Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> > http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> > __________ NOD32 3128 (20080523) Information __________<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> > This message was checked by NOD32 antivirus system.<o:p></o:p> > http://www.eset.com<o:p></o:p> ><o:p> </o:p> ><o:p> </o:p> ><o:p> </o:p> <o:p> </o:p> _______________________________________________<o:p></o:p> Gate-users mailing list<o:p></o:p> Gate-users@lists.healthgrid.org<o:p></o:p> http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<o:p></o:p> </div> </body> </html>