<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Dear JinSu<br>
<br>
regarding your first question this is a warning message generated by
GATE in the following cases<br>
a) a positron was generated but no annihilation gamma photons were
produced. If your geometry around your source was not dense enough to
ensure annihilation of some emitted positrons then it is very likely
that this warning message will appear during GATE simulation. This
warning is repeated every time a trajectory with this properties is
processed by GATE trajectory navigator.<br>
<br>
b) a positron was generated and then either 1 or more than 2
annihilation gammas were produced. In most cases you would expect to
have two annihilation gammas. So this is unlikely to happen.<br>
In your case one gamma photon was generated after the positron. This is
strange for GATE trajectory navigator and we might need to investigate
it further.<br>
Please can you give us more details on this. For example, was this
warning message produced many times? What kind of source have you used?
What was the geometry of your phantoms?<br>
If you repeat the simulation with a thicker surrounding attenuation
volume, will you still get these warnings?<br>
<br>
<br>
<br>
As far as the second question is concerned the GATE developers
community has been investigating the methods used by GATE to calculate
positron range recently because we observed some strange results
regarding the positron annihilation distance. It is likely to have
discrepancies between literature and GATE.<br>
However we would like you to tell us how did you estimate the positron
range you mention. <br>
Is this question related to the same simulation that generated the
previous warning message?If not, then what kind of source have you used
and what was it's shape and dimensions.<br>
Moreover it will be helpful if you can tell us a little more about the
properties (shape, dimensions) of the water volume that surrounded your
source.<br>
<br>
Nicolas<br>
<br>
Nicolas Karakatsanis<br>
PhD Candidate<br>
School of Electrical and Computer Engineer<br>
National Technical University of Athens<br>
<br>
&nbsp;<br>
JinSu Kim wrote:
<blockquote cite="mid:001601c82db3$281af3b0$3f8311ac@LocalHost"
 type="cite">
  <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; ">
  <meta name="Generator" content="Microsoft Word 11 (filtered medium)">
  <style>
<!--
 /* Font Definitions */
 @font-face
        {font-family:Batang;
        panose-1:2 3 6 0 0 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:Gulim;
        panose-1:2 11 6 0 0 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:"Comic Sans MS";
        panose-1:3 15 7 2 3 3 2 2 2 4;}
@font-face
        {font-family:Gulim;
        panose-1:2 11 6 0 0 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:Batang;
        panose-1:2 3 6 0 0 1 1 1 1 1;}
 /* Style Definitions */
 p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        text-align:justify;
        text-justify:inter-ideograph;
        text-autospace:none;
        word-break:break-hangul;
        font-size:10.0pt;
        font-family:Batang;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal;
        font-family:Gulim;
        color:windowtext;}
span.EmailStyle18
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:Gulim;
        color:navy;}
@page Section1
        {size:595.3pt 841.9pt;
        margin:99.25pt 3.0cm 3.0cm 3.0cm;
        layout-grid:18.0pt;}
div.Section1
        {page:Section1;}
-->
  </style>
<!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
 <o:shapelayout v:ext="edit">
  <o:idmap v:ext="edit" data="1" />
 </o:shapelayout></xml><![endif]-->
  <div class="Section1" style="">
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">Dear Gate
users<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">1<sup>st</sup>
question is ..<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">During gate
simulation, I found
following error message<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">Is it
negligible?<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">[GateTrajectoryNavigator::FindAnnihilationGammasTrackID]&nbsp;
WARNING : positron found and photonID vector size: 1<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">2<sup>nd</sup>
question is about the
Positron range of F-18<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">In the
literature, positron range of
F-18 was 0.2 mm at water<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">However, I
found that the positron
range of F-18 was 0.43 mm at water in GATE simulation.<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">What is the
difference of that?<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US">Best regards<o:p></o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#44404;&#47548;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: Gulim;" lang="EN-US"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  <div>
  <p class="MsoNormal"><font color="navy" face="Comic Sans MS" size="2"><span
 style="font-size: 10pt; font-family: &quot;Comic Sans MS&quot;; color: navy;"
 lang="EN-US">&nbsp;</span></font><font face="&#44404;&#47548;"><span
 style="font-family: Gulim;" lang="PT-BR"><o:p></o:p></span></font></p>
  </div>
  <p class="MsoNormal"><font face="&#48148;&#53461;" size="2"><span
 style="font-size: 10pt;" lang="PT-BR"><o:p>&nbsp;</o:p></span></font></p>
  </div>
  <br>
  <br>
__________ NOD32 2680 (20071123) Information __________<br>
  <br>
This message was checked by NOD32 antivirus system.<br>
  <a moz-do-not-send="true" href="http://www.eset.com">http://www.eset.com</a><br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
_______________________________________________
Gate-users mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Gate-users@lists.healthgrid.org">Gate-users@lists.healthgrid.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users</a>



__________ NOD32 2680 (20071123) Information __________

This message was checked by NOD32 antivirus system.
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.eset.com">http://www.eset.com</a>
  </pre>
</blockquote>
<br>
</body>
</html>