<br><font size=2 face="sans-serif">Hi, Fernando and Yu,</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">Thank you for your comments.</font>
<br>
<br><font size=2 face="sans-serif">First I agree with Fernando for this statement:</font>
<br><font size=2 face="sans-serif">&quot; </font><font size=2><tt>If an event arrives at time t, then a coincidence will be<br>
counted for en event in [t-tau] or [t+tau] but not [t+2tau] or [t-2tau]&quot;</tt></font>
<br>
<br><font size=2><tt>Sencond, I would explain a little more. In Gate, according to the algorithm been used</tt></font>
<br><font size=2><tt>((newPulse-&gt;GetTime()&gt;=m_startTime+m_offsetWindow) &amp;&amp; (newPulse-&gt;GetTime()&lt;(m_startTime+m_offsetWindow+m_coincidenceWindow)) ,</tt></font>
<br><font size=2><tt>when we setup the parameter by the command &quot;/gate/digitizer/Coincidences/setWindow&quot;, we should set the value as tau, not two tau.</tt></font>
<br><font size=2><tt>When the PET manufacturer provides the specification of &quot;coincidence window&quot;, they mean two tau. This is the difference.</tt></font>
<br><font size=2><tt><br>
</tt></font>
<br>
<br>
<br>
<br>
<table width=100%>
<tr valign=top>
<td>
<td><font size=1 face="sans-serif"><b>Fernando Rannou &lt;rannou@diinf.usach.cl&gt;</b></font>
<p><font size=1 face="sans-serif">04/26/2007 11:28 AM</font>
<br>
<td><font size=1 face="Arial">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; </font>
<br><font size=1 face="sans-serif">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; To: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&quot;Chen, Yu&quot; &lt;Yu.Chen@umassmed.edu&gt;</font>
<br><font size=1 face="sans-serif">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; cc: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;yuxuan.zhang@di.mdacc.tmc.edu, gate-users@lists.healthgrid.org</font>
<br><font size=1 face="sans-serif">&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; Subject: &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;RE: [Gate-users] question about the coincidence window</font></table>
<br>
<br>
<br><font size=2><tt>This issue was discussed 3 years ago. I asked a very similar<br>
question when I wanted to compare random rates using two approaches.<br>
<br>
If an event arrives at time t, then a coincidence will be<br>
counted for en event in [t-tau] or [t+tau] but not [t+2tau] or [t-2tau]<br>
<br>
<br>
Fernando Rannou<br>
<br>
On Thu, 2007-04-26 at 12:14 -0400, Chen, Yu wrote:<br>
&gt; Hi, Yuxuan,<br>
&gt; <br>
&gt; nice question.<br>
&gt; I have not any experience on coincidence package in GATE since<br>
&gt; I use our standalone coincidence program from GATE singles output, and<br>
&gt; we can have complete control such as choosing of paralyzable or<br>
&gt; nonparalyzable<br>
&gt; model.<br>
&gt; <br>
&gt; In my opinion, coincidence window is an very important parameter in<br>
&gt; any<br>
&gt; coincidence experiment. It must be allowed to easily changed by users<br>
&gt; either<br>
&gt; for GATE or for any specific PET scanner.<br>
&gt; <br>
&gt; I do not completely understand what you said here for single pulse<br>
&gt; width.<br>
&gt; <br>
&gt; Do you talk about width of two singles or coincidence output signal?<br>
&gt; <br>
&gt; If about width of single photon pulse, I do not think this width<br>
&gt; should be<br>
&gt; directly associated with coincidence window. As I know, GATE only<br>
&gt; gives a time stamp<br>
&gt; to any particular singles since no electronics response is simulated<br>
&gt; in GATE.<br>
&gt; <br>
&gt; If about width of coincidence signal, why are you bothered with it?<br>
&gt; What you need is<br>
&gt; a count which is only dependent on coincidence window and model in<br>
&gt; GATE, and of course<br>
&gt; in real scanner also dependent on the width of two single pulses. As<br>
&gt; long as you set<br>
&gt; your coincidence window greater than twice of single pulse width,<br>
&gt; coincidence count would<br>
&gt; be no longer dependent on single pulse width. &nbsp;<br>
&gt; <br>
&gt; For GATE application, what you need to do is to use the same<br>
&gt; parameters from your real scanner,<br>
&gt; e.g., 10 ns coincidence window, paralyzable model to get the same<br>
&gt; results.<br>
&gt; <br>
&gt; Hope it helps.<br>
&gt; <br>
&gt; Yu Chen, Ph.D.<br>
&gt; University of Massachusetts Medical School<br>
&gt; Division of Nuclear Medicine<br>
&gt; 55 Lake Avenue North<br>
&gt; Worcester, MA 01655-0243<br>
&gt; Phone: &nbsp;(508) 856-6123<br>
&gt; Fax: &nbsp; &nbsp;(508) 856-4572<br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; -----Original Message-----<br>
&gt; From: gate-users-bounces@lists.healthgrid.org on behalf of<br>
&gt; yuxuan.zhang@di.mdacc.tmc.edu<br>
&gt; Sent: Wed 4/25/2007 6:35 PM<br>
&gt; To: gate-users@lists.healthgrid.org<br>
&gt; Subject: [Gate-users] question about the coincidence window<br>
&gt; <br>
&gt; hi All,<br>
&gt; <br>
&gt; I have a question about the definition of the coincidence time window,<br>
&gt; which might be<br>
&gt; different among the GATE society and the nuclear electronics people.<br>
&gt; <br>
&gt; According to the GATE user's manual, the coincidence window is the<br>
&gt; width<br>
&gt; of the single pulse,<br>
&gt; however, according to some literature and electronics engineering<br>
&gt; people,<br>
&gt; the coincidence windows<br>
&gt; are defined as twice of the width of the single pulse. So if they say<br>
&gt; one<br>
&gt; PET camera has a<br>
&gt; coincidence window of 10 ns, this should mean that the width of the<br>
&gt; single<br>
&gt; pulse is 5 ns.<br>
&gt; If this is the case, then we should setup the coincidence window in<br>
&gt; GATE<br>
&gt; simulation as 5 ns<br>
&gt; rather than 10 ns.<br>
&gt; <br>
&gt; I've checked several published papers about the validation of the<br>
&gt; GATE, no</tt></font>
<br><font size=2><tt>&gt; one has made any comment<br>
&gt; on this issue explicitly. So I brought this to you attention and hope<br>
&gt; you<br>
&gt; can give some comments.<br>
&gt; <br>
&gt; Best regards,<br>
&gt; <br>
&gt; Yuxuan<br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; <br>
&gt; -- <br>
&gt; Este mensaje ha sido analizado por MailScanner <br>
&gt; en busca de virus y otros contenidos peligrosos, <br>
&gt; y se considera que está limpio. <br>
&gt; MailScanner agradece a transtec Computers por su apoyo. <br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; Gate-users mailing list<br>
&gt; Gate-users@lists.healthgrid.org<br>
&gt; http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users<br>
<br>
<br>
-- <br>
Este mensaje ha sido analizado por MailScanner<br>
en busca de virus y otros contenidos peligrosos,<br>
y se considera que est�impio.<br>
MailScanner agradece a transtec Computers por su apoyo.<br>
<br>
</tt></font>
<br>
<br>