<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7651.59">
<TITLE>RE: [Gate-users] question about the coincidence window</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Then it is an assue about GATE implementation not<BR>
consistent with standard definition in any of paralyzable<BR>
or nonparalyzable model?<BR>
<BR>
If it is true, I am fortunate to use my own code to avoid this<BR>
inconsistence.<BR>
<BR>
Thanks,<BR>
<BR>
Yu Chen, Ph.D.<BR>
University of Massachusetts Medical School<BR>
Division of Nuclear Medicine<BR>
55 Lake Avenue North<BR>
Worcester, MA 01655-0243<BR>
Phone:&nbsp; (508) 856-6123<BR>
Fax:&nbsp;&nbsp;&nbsp; (508) 856-4572<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: Fernando Rannou [<A HREF="mailto:rannou@diinf.usach.cl">mailto:rannou@diinf.usach.cl</A>]<BR>
Sent: Thu 4/26/2007 12:28 PM<BR>
To: Chen, Yu<BR>
Cc: yuxuan.zhang@di.mdacc.tmc.edu; gate-users@lists.healthgrid.org<BR>
Subject: RE: [Gate-users] question about the coincidence window<BR>
<BR>
This issue was discussed 3 years ago. I asked a very similar<BR>
question when I wanted to compare random rates using two approaches.<BR>
<BR>
If an event arrives at time t, then a coincidence will be<BR>
counted for en event in [t-tau] or [t+tau] but not [t+2tau] or [t-2tau]<BR>
<BR>
<BR>
Fernando Rannou<BR>
<BR>
On Thu, 2007-04-26 at 12:14 -0400, Chen, Yu wrote:<BR>
&gt; Hi, Yuxuan,<BR>
&gt;<BR>
&gt; nice question.<BR>
&gt; I have not any experience on coincidence package in GATE since<BR>
&gt; I use our standalone coincidence program from GATE singles output, and<BR>
&gt; we can have complete control such as choosing of paralyzable or<BR>
&gt; nonparalyzable<BR>
&gt; model.<BR>
&gt;<BR>
&gt; In my opinion, coincidence window is an very important parameter in<BR>
&gt; any<BR>
&gt; coincidence experiment. It must be allowed to easily changed by users<BR>
&gt; either<BR>
&gt; for GATE or for any specific PET scanner.<BR>
&gt;<BR>
&gt; I do not completely understand what you said here for single pulse<BR>
&gt; width.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Do you talk about width of two singles or coincidence output signal?<BR>
&gt;<BR>
&gt; If about width of single photon pulse, I do not think this width<BR>
&gt; should be<BR>
&gt; directly associated with coincidence window. As I know, GATE only<BR>
&gt; gives a time stamp<BR>
&gt; to any particular singles since no electronics response is simulated<BR>
&gt; in GATE.<BR>
&gt;<BR>
&gt; If about width of coincidence signal, why are you bothered with it?<BR>
&gt; What you need is<BR>
&gt; a count which is only dependent on coincidence window and model in<BR>
&gt; GATE, and of course<BR>
&gt; in real scanner also dependent on the width of two single pulses. As<BR>
&gt; long as you set<BR>
&gt; your coincidence window greater than twice of single pulse width,<BR>
&gt; coincidence count would<BR>
&gt; be no longer dependent on single pulse width.&nbsp;<BR>
&gt;<BR>
&gt; For GATE application, what you need to do is to use the same<BR>
&gt; parameters from your real scanner,<BR>
&gt; e.g., 10 ns coincidence window, paralyzable model to get the same<BR>
&gt; results.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Hope it helps.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Yu Chen, Ph.D.<BR>
&gt; University of Massachusetts Medical School<BR>
&gt; Division of Nuclear Medicine<BR>
&gt; 55 Lake Avenue North<BR>
&gt; Worcester, MA 01655-0243<BR>
&gt; Phone:&nbsp; (508) 856-6123<BR>
&gt; Fax:&nbsp;&nbsp;&nbsp; (508) 856-4572<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; -----Original Message-----<BR>
&gt; From: gate-users-bounces@lists.healthgrid.org on behalf of<BR>
&gt; yuxuan.zhang@di.mdacc.tmc.edu<BR>
&gt; Sent: Wed 4/25/2007 6:35 PM<BR>
&gt; To: gate-users@lists.healthgrid.org<BR>
&gt; Subject: [Gate-users] question about the coincidence window<BR>
&gt;<BR>
&gt; hi All,<BR>
&gt;<BR>
&gt; I have a question about the definition of the coincidence time window,<BR>
&gt; which might be<BR>
&gt; different among the GATE society and the nuclear electronics people.<BR>
&gt;<BR>
&gt; According to the GATE user's manual, the coincidence window is the<BR>
&gt; width<BR>
&gt; of the single pulse,<BR>
&gt; however, according to some literature and electronics engineering<BR>
&gt; people,<BR>
&gt; the coincidence windows<BR>
&gt; are defined as twice of the width of the single pulse. So if they say<BR>
&gt; one<BR>
&gt; PET camera has a<BR>
&gt; coincidence window of 10 ns, this should mean that the width of the<BR>
&gt; single<BR>
&gt; pulse is 5 ns.<BR>
&gt; If this is the case, then we should setup the coincidence window in<BR>
&gt; GATE<BR>
&gt; simulation as 5 ns<BR>
&gt; rather than 10 ns.<BR>
&gt;<BR>
&gt; I've checked several published papers about the validation of the<BR>
&gt; GATE, no<BR>
&gt; one has made any comment<BR>
&gt; on this issue explicitly. So I brought this to you attention and hope<BR>
&gt; you<BR>
&gt; can give some comments.<BR>
&gt;<BR>
&gt; Best regards,<BR>
&gt;<BR>
&gt; Yuxuan<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; --<BR>
&gt; Este mensaje ha sido analizado por MailScanner<BR>
&gt; en busca de virus y otros contenidos peligrosos,<BR>
&gt; y se considera que está limpio.<BR>
&gt; MailScanner agradece a transtec Computers por su apoyo.<BR>
&gt; _______________________________________________<BR>
&gt; Gate-users mailing list<BR>
&gt; Gate-users@lists.healthgrid.org<BR>
&gt; <A HREF="http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users">http://lists.healthgrid.org/mailman/listinfo/gate-users</A><BR>
<BR>
<BR>
--<BR>
Este mensaje ha sido analizado por MailScanner<BR>
en busca de virus y otros contenidos peligrosos,<BR>
y se considera que est limpio.<BR>
MailScanner agradece a transtec Computers por su apoyo.<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>